miniaturadeimagen|280px|Uzbekistán miniaturadeimagen|280px|Áreas protegidas de Uzbekistán Según la IUCN, en 2025 había en Uzbekistán 53 áreas protegidas, que ocupaban 63 356 km², el 14,11% de la superficie de país, 448 925 km². De estas, 13 son parques naturales nacionales, 10 son monumentos naturales, 7 son reservas estatales, 2 son reservas de la biosfera estatales, 13 son santuarios de la naturaleza con diferentes estatus, 1 es un vivero natural, 1 es una reserva de la biosfera de la Unesco, 4 son sitios Ramsar y 2 son sitios patrimonio de la humanidad. Desde el año 2020, se ha producido una reconfiguración total de las áreas protegidas de Uzbekistán. miniaturadeimagen|Parque nacional de Chatkal. miniaturadeimagen|Oso pardo del Himalaya, presente en las montañas del Tien Shan, fotografiado en el zoo de Hluboka. miniaturadeimagen|Cordillera de Chaktal En Uzbekistán, con el 85% del territorio ocupado por desiertos y el 15% por montañas y colinas, hay unas 4374 especies de plantas vasculares, de las que el 20% son endémicas. Entre las más populares, la rosa mosqueta el Iris aucheri, la Alcea, la Filipendula, el nomeolvides, el pachuli, la esclarea, el cártamo, el Helianthus y la petunia. Entre las nativas, Tulipa linifolia y Tulipa clusiana. La mayoría crece en las montañas, aunque solo el 30% de las altas montañas están cubiertas de plantas, y la mayoría son de pequeño tamaño. A media montaña crecen arbustos, entre los que destaca la rosa canina, y en zonas más bajas crecen árboles caducifolios y principalmente abetos, algunos milenarios. Entre los demás, manzanos, espinos, pistachos, nogales, abedules, chopos y cerezos. Entre las matas bajas, la sabina rastrera. En los desiertos, destaca el saxaúl en Kyzyl Kum. Entre los animales, lobos, chacales y zorros en las zonas desérticas, además de ciervos de Bujará o bactrianos (Cervus elaphus bactrianus). En las montañas que bordean Kirguistán y Tayikistán, el oso pardo, la cabra montés, el lince de Bujará y el íbice, y entre las especies en peligro podría haber leopardo de las nieves y antílope saiga. Hay sesenta tipos de peces y numerosos invertebrados endémicos.
Parques nacionales miniaturadeimagen|Entrada del parque nacional de Zaamin miniaturadeimagen|Restos del mar de Aral en 2014 miniaturadeimagen|Parque nacional de Aralkum Parque nacional Zaamin, 234 km². Es la reserva más antigua, creada en 1926 como reserva natural, al norte de la parte occidental de la cordillera de Turquestán, cerca de Taskent, en las montañas Zaamin. En 1978 tenía 241 km². Se eleva desde los 1700 m en el valle de Guaralash hasta los 3571 del monte Guralash. Hay unas 700 especies de plantas (un nogal de 700 años) y 40 de mamíferos. Hay lince de Turkestán (Lynx lynx isabellinus), quebrantahuesos y oso tibetano. El parque se creó para proteger un ecosistema único de pinos. Otro de los valores del parque es el enebro de Asia Central (Juniperus semiglobosa), que alcanza los 18 m de altura y uno de los cuales tiene cerca de mil años.
Parque nacional de Ugam-Chatkal (Ugam-Chatkal State National Nature Park), 5745 km². En el nordeste de Tahskent, creado en 1992 a partir de la reserva de la biosfera de Chaktal, de 570 km2. Se encuentra en la cordillera de Chaktal y el oeste de Tien Shan, englobando las reservas forestales de Akhangaran, Brichmulla y Chirchik, y desde su ampliación la cordillera Ugam, de hasta 4000 m de altitud. Se creó para proteger los bosques altos de Tien Shan, que forman un ecosistema único. El norte y el este están arbolados, mientras que el sur está escasamente arbolado o son campos abiertos. También hay plantaciones de almendros, manzanos y pino negro. La fauna incluye 280 especies, de las que 44 son de mamíferos, 200 de aves, 16 de reptiles y 20 de peces. Destacan el oso pardo del Himalaya, el jabalí, los lobos, los zorros y las codornices. Hay más de 1000 especies de plantas, algunas endémicas, como ciertos tipos de tulipanes, y unos 70 tipos de árboles. Una de sus atracciones es el lago Charvak, en la zona más baja, a (metros sobre el nivel del mar), y la cima del Gran Chimgan, de , y en la cordillera de Ugam, entre Uzbekistán y Kazajistán, el monte Sairam, de 4299 m. Hay cascadas de 30 a 40 m y petroglifos en la cueva Khodjikent. La nieve cubre las partes altas cuatro o cinco meses y las precipitaciones medias son de 650 mm en el monte Chimgan.
Parque nacional de Zeravshan, 24,26 km2, antes reserva natural con 47 km2. En los distritos de Jambay y Bulungur, en la región de Samarkanda, a lo largo de la orilla derecha del río Zeravshan, con una longitud de 47 km. El terreno es prácticamente llano, con terrazas que van de 620 a 900 m de altitud. Hay unas 300 especies de plantas, entre ellas tamariscos, sauces, espinos amarillos, agracejos, carrizales, etc. Hay unas 26 especies de mamíferos, y más de 216 de aves. Hay recorridos para turistas y un pequeño zoo.
Parque geológico nacional de Kitab antes Reserva geológica estatal de Kitab, 39,38 km2, en el distrito de Kitab, en la provincia de Kashkadar, en el sudeste del país. Incluye características paleoestratigráficas de la provincia turania en el río Dzindarya, en las vertientes septentrionales de Sumsara y Karataga, y las vetientes sudocccidentales de la cordillera de Zeravshan, con al menos seis gargantas en la zona. Entre 1500 y 2500 m con rocas de entre 300-400 millones de años. El suelo es sierozem, un tipo de suelo marrón grisáceo propio de clima desértico frío. Hiela durante tres meses y la nieve puede alcanzar un metro de altura hasta fundirse en marzo. La mitad del área está arbolada, un cuarto son laderas rocosas y el resto son praderas. Entre las plantas, Juniperus y Ephedra. Hay 35 tipos de plantas medicinales, y entre los árboles, además de las sabinas, arces, ciruelos, espinos y manzanos. Hay lobos, zorros, osos, jabalíes, garduñas y tejones. miniaturadeimagen|Parque nacional de Amankután Parque nacional de Amankután, 31 km2, según la IUCN, Omankután por la forma uzbeka, pero se refiere a la Reserva natural del desfiladero de Amankután (Amankutan Gorge Natural Preserve), unos 40 km al sur de Samarkanda cerca de Urgut. Se supone que por este paso de montaña a través de los montes Chakylkalyan o Zeravshan atravesaron Alejandro Magno, mongoles, árabes y persas, y entre los nombres conocidos Ruy González de Clavijo e Ibn Batuta. En la garganta, en la parte media del arroyo de Bulbulzarsay, se encuentra la cueva de Amankután, con restos humanos y de animales extintos hace casi cien mil años. miniaturadeimagen|Lago Sariqamish, cuya parte septentrional forma parte del Parque natural nacional de Ustyurt Sur. miniaturadeimagen|Vista del lago Sariqamish en Uzbekistán Parque nacional de Ustyurt Sur, 10.231 km2. Cerca de Kungrad, en Karakalpakistán, al oeste de Uzbekistán, cerca del lecho del mar de Aral, en la parte meridional de la meseta de Ustyurt. Se crea en 2020. Es un inmenso desierto de yeso, con una mezcla de arcillas, arena y grava, sometido a un extremo calor y sequedad. Una de sus características son los desfiladeros hechos de creta y caliza excavados por la antigua regresión de los mares. Pueden tener cientos de metros de profundidad y albergar cavernas y plataformas, con algo de vegetación arbustiva e incluso con algún manantial. Es el hogar del kulan o asno salvaje de Transcapia, la gacela persa y el urial. En las grutas hay distintos tipos de murciélagos. En el extremo sur de encuentra el lago Sarykamysh, compartido con Turkmenistán, creado en la década de 1960 cuando una descarga del Amu Daria inundó la depresión de Sarykamysh, creando una zona de interés para los observadores de aves.
Parque nacional de Korezm, 217 km2. En el sudoeste de Uzbekistán, en el bajo Amu Daria, en la provincia de Korezm o Korazm o Juarizm, conocida en español como Corasmia, en la parte norte de la depresión del Turán, en la orilla izquierda del antiguo delta del Amu Daria y una pequeña parte del desierto de Kyzyl Kum en la orilla derecha. Es una zona árida caracterizada por los grandes extremos, pues en verano se alcanzan los 43 a 54 oC y en invierno, de -16 a -28 oC. Las lluvias oscilan entre 120 y 140 mm anuales. La vegetación dominante es el saxaúl, un arbusto grande de hojas muy pequeñas. Entre los animales hay jabalíes, gatos salvajes, tejones, linces y chacales.
Parque nacional de Aralbuyi, 31,65 km2. También se conoce como Parque nacional Priaralie o Parque nacional del lago Aidarkul. Priaral significa alrededor del Aral. En el distrito Buzatov de la República de Karakalpakistán. Al noroeste del lago Davutkul, a una altitud de 55-65 m, una longitud de 15 km y una anchura de 1-1,5 km, prácticamente seco al sur de lo que era el mar de Aral. Se crea con el fin de preservar la rareza del lugar. Más de 28 km2 del territorio consisten en el tipo de bosque de ribera llamado tugai (sauces y álamos), carrizales, matorrales y arbustos. Clima continental, con medias en enero de -5oC y en julio de 32oC, con lluvias que apenas superan los 110 mm y un periodo vegetativo de solo 90 a 100 días. El parque limita con la Reserva de la biosfera de Amudarya por el oeste y el noroeste. Hay 16 especies de mamíferos, y dos de reptiles en la lista roja: el varano del desierto y la tortuga rusa. El parque natural se encuentra a unos 80 km de la ciudad de Nukus, la más cercana.
Parque nacional de Aralkum, 10.000 km2. En el distrito de Muynak de la República de Karakalpakistán. Está rodeado por páramos en el noroeste, por la Empresa Estatal Forestal de Muynak (Muynak State Forestry Enterprise) al sudoeste, la Empresa Estatal Forestal de Kazakdaryin (Kazakdaryin State Forestry Enterprise), al sudeste y la República de Kazajistán, al norte. Del millón de hectáreas del parque, 585.000 son zonas protegidas, 125.000 son áreas recreativas y 290.000 tienen propósitos económicos. El parque se encuentra entre 25 y 50 m de altitud con su mayor altitud en el pico Vozrozhdeniye, en la isla del mismo nombre, que una vez fue una isla pequeña en el mar de Aral y ahora está en medio de un desierto de rocas, arena, grava, caliza, arcilla y conglomerados. Entre las plantas, se encuentra el género Haloxylon, Caucalis gummifera, el género Calligonum, carrizos, tamariscos y, en algunas zonas, el género Cistanche. Entre la fauna, hay antílopes saiga, lobos, chacales, zorros, liebres, jabalíes, etc. Entre las aves hay búhos, cuervos y el gorrión sahariano. En la zona turística, interesa el pozo artesiano que hace emerger agua desde 700 m de profundidad en el lecho del mar de Aral. El asentamiento más cercano es la villa de Uchsai, a 40 km.
Parque nacional de Babatag, 120,64 km2, de los que 80 km2 son zona protegida, 30 km² son áreas recreativas y 10,64 km² son zonas económicas. Al este de la provincia de Surjandaria, en el sudeste del país, en la frontera con Tayikistán, entre los ríos Surjandaria y Kofarnihon, siguiendo una estrecha franja que discurren de nordeste a sudoeste hasta el río Amu Daria. El punto más alto es el monte Zarkosa, a (metros sobre el nivel del mar). Está formado por calizas del Paleógeno y el Jurásico, arcillas, aleuritas y areniscas. La vertiente oriental es estrecha, con terrazas a los pies de las montañas junto al río Kofarnihon. La occidental es más llana y ancha, formada por montañas más bajas. El clima es seco y frío, con lluvias de 170 a 400 mm, con sequía en verano, aunque hay numerosos manantiales y algún lago pequeño. Hay unas 300 especies de plantas de montaña, y entre los animales, hay hienas y cabras montesas en las colinas arboladas, así como urial de Bujará (Ovis vignei bochariensis), garduña, la cabra bezoar, tejones, serpientes, cobras, buitres negros, halcones y se dice que leopardo de las nieves. miniaturadeimagen|Desierto de Kyzyl Kum