direita|thumb|300px|Mapa topográfico do arquipélago nipónico
Ilhas principais O Japão é um país-arquipélago que compreende, basicamente, cinco ilhas principais. São elas:
Mappa Nome Superficie (km²) Hokkaidō 77.984,86 Honshū 227.976,10 Shikoku 18.301,17 Kyūshū 36.753,00 Okinawa 1,206.99
Ilhas menores O Japão tem cerca de 6000 ilhas no total e 426 destas são habitadas. Entre estas também figuram ilhas disputadas, ilhas que surgem com a maré baixa e ilhas artificiais com no mínimo 0,1 km².
Ilhas do norte No extremo norte do Japão, existem 4 ilhas disputadas com a Rússia, no denominado conflito das Ilhas Curilhas. São elas: Imagem Ilha Área 100px Etorofu 3139 km² 100px Habomai 51 km² 100px Kunashiri 1490 km² 100px Shikotan 225 km²
Hokkaido Imagem Ilha Área 100px Ilha Kamome 2.6 km² 100px Ilha Okushiri 142.97 km² Ilha Yagishiri 5.21 km² Ilha Teuri Ilha Rebun Ilha Rishiri Ilha Ooshima Ilha Kojima
Ilhas na região de Honshu no Mar do Japão Imagem Ilha Área Rochedos de Liancourt (Takeshima/Dokdo) - disputadas com a Coreia do Sul Ilha Oki Ilha Sado Ilha Todo Mitsukejima
Ilhas na Baía de Tóquio (artificiais) Yume No Shima Odaiba Saru Island (natural) Ilha Heiwa (:ja:平和島) Showa Island (:ja:昭和島) Ilha Keihin (:ja:京浜島) Aeroporto Internacional de Tóquio Katsushima (:ja:勝島) Hakkeijima (:ja:横浜・八景島シーパラダイス) Higashi Ogijima (:ja:東扇島)
Ilhas no Oceano Pacífico Ilhas Izu Aogashima Hachijō Izu Ōshima Kozushima Miyakejima Mikurajima Niijima Shikinejima Ilha Toshima Torishima (Ilhas Izu) Ilhas Ogasawara Chichi-jima Haha-jima Iwo Jima Minami Torishima (Ilhas Marcus) Okino Torishima (Parece Vela) Enoshima
Ilhas em volta de Kyūshū A maioria destas estão do Mar da China Oriental. Hiroshima Amakusa Ilhas Gotō Ilha Hirado Ilha Hashima Ilha Iki Ilhas Koshikijima Ilhas Tsushima
Ilhas Nansei (Ryūkyū) Ilhas de Satsunan Ilhas Ōsumi Parte nordeste: Tanegashima Yakushima Kuchinoerabujima Mageshima Parte noroeste: Takeshima Iojima Kuroshima
Ilhas Tokara Shichi-tō: Kuchinoshima Nakanoshima Gajajima Suwanosejima Akusekijima Tairajima Kodakarajima Takarajima
Ilhas Amami Amami Ōshima Kikaigashima Kakeromajima Yoroshima Ukeshima Tokunoshima Okinoerabujima Yoronjima
Ryūkyū Shotō Ilhas Okinawa Parte central: Okinawa (Okinawan principal, Okinawa hontō) Kumejima Iheyajima Izenajima Agunijima Iejima Iwo Tori Shima (Iōtorishima) Ilhas Kerama: Tokashikijima Zamamijima Akajima Gerumajima Ilhas Daito: Kita daitō Minami daitō Oki Daitō
Ilhas de Sakishima Ilhas Miyako: Miyakojima Ikema Ogami Irabu Shimoji Kurima Minna Tarama Ilhas Yaeyama: Iriomote Ishigaki Taketomi Kohamajima Kuroshima Aragusuku Hatoma Yubujima Hateruma Yonaguni Ilhas Senkaku (disputadas com a República Popular da China e Formosa): Uotsurijima Kuba Jima Taisho Jima Kita Kojima Minami Kojima
Ilhas no Mar Interior Ilhas Kasaoka: Ilha Takashima (Okayama) Ilha Shiraishi Ilha Kitagi Ilha Obishi Ilha Kobi Ilha Manabe Ilha Mushima (Okayama) Ilhas Shiwaku Awaji Etajima Itsukushima (Miyajima) Shōdoshima Suō-Ōshima (Yamaguchi)
Ilhas dentro de lagos Ilha Daikon Bentenjima no Lago Toya Bentenjima no Lago Hamana
Outras ilhas artificiais Aeroporto Internacional de Chūbu Centrair Dejima Aeroporto Internacional de Kansai Aeroporto de Kobe Ilha Port Ilha Rokko Aeroporto de New Kitakyushu
Japao Ilhas