La diócesis de San Isidro de El General o de San Isidro () es una circunscripción eclesiástica de la Iglesia católica en Costa Rica. Se trata de una diócesis latina, sufragánea de la arquidiócesis de San José. Desde el 13 de noviembre de 2021 su obispo es Juan Miguel Castro Rojas.
Territorio y organización thumb|miniatura|derecha|Mapa de parroquias de la diócesis de San Isidro de El General
La diócesis tiene 10 646 km² y extiende su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en la parte meridional de la provincia de Puntarenas (cantones de Osa, Buenos Aires, Corredores, Golfito y Coto Brus) y la parte meridional de la provincia de San José (cantones de Dota, Tarrazú y Pérez Zeledón).Nuestra Diócesis en el sitio oficial de la diócesis. La zona costera es considerada zona de misión.
La sede de la diócesis se encuentra en la ciudad de San Isidro de El General, en donde se halla la Catedral de San Isidro Labrador.
En 2025 en la diócesis existían 27 parroquias agrupadas en 6 vicarías foráneas:
Vicaría San Padre Pío thumb|miniatura|derecha|Mapa de la vicaría San Padre Pío, por parroquias y sectores thumb|miniatura|derecha|Mapa del centro urbano de la vicaría de San Padre Pío, por parroquias y filiales
Ubicación: Provincia: San José Cantón: Pérez Zeledón
Conformada por las siguientes parroquias: San Isidro Labrador, Catedral, San Isidro de El General Distrito: San Isidro de El General Poblado: San Isidro de El General (Ciudad) La parroquia abarca casi en su totalidad el distrito de San Isidro de El General, además de una gran parte del distrito de Páramo. Sus filiales se organizan en los siguientes sectores: Sector San Isidro: San Isidro, Tierra Prometida, Valverde, Pedregoso, El Calvario, Cooperativa, 8 de Diciembre, El Hoyón, La Palma, El Roble y La Guaria. Sector Sagrada Familia: Sagrada Familia, Cristo Rey, Cocorí, Divino Niño, Pavones, Aeropuerto y El Rosario. Sector La Ceniza: La Ceniza, Toledo, La Angostura, Ojo de Agua, Las Esperanzas, La Ribera, San Agustín, El Ceibo y Morete.
Inmaculada Concepción, Rivas Distrito: Rivas Poblado: Rivas La parroquia abarca casi la totalidad del distrito de Rivas, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: Rivas: Rivas, Pueblo Nuevo, Linda Vista, San Martín, Tirrá y San Antonio. Buena Vista: Buena Vista, La Piedra, Palmital y San Juan Norte. San Gerardo: San Gerardo, Chimirol, Herradura, Guadalupe, Canaán, San José, Los Ángeles y San Francisco.
San Miguel Arcángel, General Viejo Distrito: El General Poblado: General Viejo La parroquia abarca en su totalidad el distrito de El General, además de dos comunidades del distrito de Cajón y una de Daniel Flores, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: General Viejo: General Viejo, San Blas, Miraflores, La Linda y San Luis. Santa Elena: Santa Elena, La Hermosa, Quizarrá, La Paz y Montecarlo. Peñas Blancas: Peñas Blancas, Pinar, San Martín y La Inmaculada.
Nuestra Señora de Guadalupe, Platanillo Distrito: Barú Poblado: Platanillo La parroquia abarca la totalidad del distrito de Barú, además de 3 comunidades de San Isidro de El General, organiza sus filiales en los siguientes sectores: Platanillo: Platanillo, San Cristóbal, La Alfombra y Caña Blanca. San Salvador: San Salvador, Las Tumbas, Santo Cristo y La Florida. San Juan de Dios: San Juan de Dios, Tres Piedras, Tierras Morenas, La Reina, El Torito y Villa Bonita. Pacuarito: Pacuarito, El Alto de San Juan y San Lorenzo.
San Ramón Nonato, San Ramón Sur Distrito: Páramo Poblado: San Ramón Sur La parroquia abarca la totalidad del distrito de Río Nuevo y una gran parte de Páramo, organiza sus filiales en los siguientes sectores. San Ramón Sur: San Ramón Sur, Arizona, Pedregosito, Providencia, San Miguel, Berlín, Matazanos, San Ramón Norte, Las Nubes y Valencia. Santa Rosa: Santa Rosa, Villa Nueva, San Antonio, Calle Moras, Santa Marta y San Cayetano. Los Ángeles: Los Ángeles, Santa Eduviges, Santo Tomás, La Lira, La California y Santa Lucía. Savegre: Savegre, Zaragoza, San Marcos, El Llano, El Brujo y Viento Fresco.
Nuestra Señora del Carmen, Barrio Morazán Distrito: San Isidro del General Poblado: Morazán La Parroquia abarca algunos barrios urbanos del distrito de San Isidro del General, así como algunas comunidades del distrito de Páramo. Organiza sus filiales en los siguientes sectores: Morazán: Morazán, La Ese, San Rafael Norte, San Luis, Quebradas y UNESCO-Durán Picado. Sinaí: Sinaí, San Andrés, La Bambú, La Bonita, Las Parcelas y Miravalles. División: División, Villa Mills, El Jardín, El Nivel, Macho Mora, Piedra Alta, El Jaular, Miramar y La Hortensia.
Vicaría Nuestra Señora de Lourdes Ubicación: Provincia: San José Cantón: Pérez Zeledón
Nuestra Señora de Lourdes, Barrio Lourdes Distrito: Daniel Flores Poblado: Lourdes La Parroquia abarca la parte norte del distrito de Daniel Flores, zona muy urbana ya que es la zona del distrito más cercana a la ciudad de San Isidro de El General, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: Lourdes: Lourdes, Los Chiles, Sagrado Corazón, Loma Verde, Las Brisas y La Lucha. Villa Ligia: Villa Ligia, Los Pinos, Rosa Iris, Los Ángeles, San Francisco y Dora Obando.
San José, Palmares Distrito: Daniel Flores Poblado: Palmares La parroquia abarca la zona sur del distrito de Daniel Flores, además de tres comunidades del distrito Cajón y una de Platanares, organiza sus filiales en los siguientes sectores: Palmares: Palmares, Daniel Flores, Baidambú, Las Lagunas y La Reforma. Repunta: Repunta, Quebrada Honda, El Peje y Las Juntas de Pacuar. Los Reyes: Los Reyes, San Juan Bosco, La Suiza, Bajo Pacuar, Cristo Rey, Bajo Las Brisas, Las Brisas y El Pilar.
San Rafael Arcángel, Platanares Distrito: Platanares Poblado: San Rafael La Parroquia abarca casi la totalidad del distrito de Platanares, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: San Rafael: San Rafael, Bolivia, Naranjo, Las Bonitas, Vista de Mar, Villa Argentina, Bajo Bonitas, San Gerardo y La Sierra. Concepción: Concepción, Buenos Aires, El Socorro, Oratorio y Aguas Buenas. San Pablo: San Pablo, Mollejones, San Pablito, Los Ángeles y San Carlos.
Nuestra Señora de Lourdes, Pejibaye Distrito: Pejibaye Poblado: Pejibaye La parroquia abarca la totalidad de los distritos de Pejibaye y La Amistad, además de 8 comunidades del cantón de Buenos Aires, 4 del distrito Pilas y 4 del distrito Colinas, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: Pejibaye: Pejibaye, Villa Hermosa, San Marcos, Las Mesas, San Miguel, Gibre, Barrio Nuevo, Desamparados, Paraíso, El Zapote, Alto La Trinidad y La Trinidad. San Antonio: San Antonio, Moctezuma, China Kichá, San Antonio Abajo, San Gabriel, Lourdes, Santa Lucía y Santa Cecilia. El Águila: El Águila, San Martín, Las Delicias, San Vicente, Pueblo Nuevo, Concepción, La Gloria, Guadalupe, Bella Vista, Santa Fe, Veracruz, Guagaral, La Virgen, Aguas Frescas y Los Ángeles.
San Pedro Apóstol, San Pedro Distrito: San Pedro Poblado: San Pedro La parroquia abarca la totalidad del distrito de San Pedro, además de la gran mayoría del distrito de Cajón, organiza sus filiales en los siguientes sectores: San Pedro: San Pedro, La Arenilla, Santa Ana, Los Ángeles, Tambor, Santo Domingo y San Rafael. El Carmen: El Carmen, Las Mercedes, Barrio México, El Quemado, Pueblo Nuevo y San Pedrito. La Guaria: La Guaria, San Jerónimo, Zapotal, Fátima, Santiago, La Nueva Hortensia, La Colonia, Cristo Rey, La Unión, La Fortuna, Santa Cecilia y La Esperanza. San Francisco: San Francisco, Santa Marta, San Ignacio, Cedral, Santa Teresa, Los Vega, Arco Iris y Santa María.
Vicaría Los Santos Ubicación: Provincia: San José Cantones: Tarrazú, Dota y León Cortés.
Está conformada por las siguientes parroquias: San Marcos Evangelista, San Marcos, Tarrazú Cantón: Tarrazú Distrito: San Marcos Poblado: San Marcos La parroquia abarca el cantón de Tarrazú, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: Sector San Marcos: San Marcos, San Pedro, Guadalupe, La Pastora, San Cayetano, La Sabana, Bajo de San Juan, Santa Cecilia, San Antonio y Santísima Trinidad Sector San Carlos: San Carlos, San Jerónimo, Santa Ana, Alto de San Juan, Bajo de San José, San Francisco y La Esperanza Sector San Lorenzo: San Lorenzo, San Isidro, San Ramón, San Gerardo, San Martín, Santa Elena, San Bernardo, Fátima, Los Ángeles, San Gabriel, San Rafael y Santa Marta.
Nuestra Señora de la Cueva Santa, Santa María, Dota Cantón: Dota Distrito: Santa María Poblado: Santa María La parroquia abarca el cantón de Dota, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: Sector Santa María: Santa María, Cedral, Jardín, San Martín, Higueronal y Quebradilla. Sector Copey: Copey, Trinidad, La Cima, San Gerardo y Providencia.
San Pablo Apóstol, San Pablo, León Cortés Castro Cantón: León Cortés Castro Distrito: San Pablo Poblado: San Pablo La parroquia abarca el cantón de León Cortés Castro, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: San Pablo: San Pablo, El Rosario, Carrizal, San Isidro, La Trinidad, San Gabriel, San Juan, San Luis, Llano Bonito, Santa Juana, Santa Rosa Abajo, Santa Rosa Arriba, La Concepción y San Francisco. San Antonio: San Antonio, Santa Cruz, La Cuesta, El Higuerón, La Angostura, Cristo Rey, Bajo Los Ángeles y Ojo de Agua.
Vicaría Beato Pablo VI Ubicación: Provincia: Puntarenas Cantón: Coto Brus
Conformada por las siguientes parroquias: Nuestra Señora de Lourdes, San Vito Distrito: San Vito Poblado: San Vito La parroquia abarca en su totalidad los distritos de San Vito y Limoncito, y pequeñas partes de Gutiérrez Braun y de Chánguena y Potrero Grande en Buenos Aires, y organiza sus sectores en los siguientes sectores: Sector San Vito: San Vito, Linda Vista, Lourdes, San Joaquín, La Isla, El Pavo, Pioneros, Limoncito, San Juan, Santa Rita y Santa Clara. Sector Sabanillas: Sabanillas, San Luis, Santa Marta, Paraíso, Las Vegas, La Casona, San Gerardo, Santa Cecilia, El Valle, La Unión, Los Ángeles y La Manchuria. Sector Los Reyes: Los Reyes, El Ceibo, La Maravilla y Sagrado Corazón. Sector Las Brisas: Las Brisas, Siete Colinas, Las Juntas, La Pintada y Aguas Claras.
Nuestra Señora de la Medalla Milagrosa, Agua Buena Distrito: Agua Buena Poblado: Agua Buena La parroquia abarca la totalidad del distrito Agua Buena, y pequeñas partes de Sabalito y Corredor, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: Sector Agua Buena: Agua Buena, Coopabuena, San Gabriel, San Martín, San Miguel, Santo Domingo, Quebrada Bonita y Pueblo Nuevo. Sector San Francisco: San Francisco, Santa Cecilia, Copal, Concepción, Valle Azul y Los Ángeles. Sector Cañas Gordas: Cañas Gordas, Pilares, Villa Roma y Los Planes. Sector Campo Tres: Campo Tres, Meta Ponto, Campo Dos y Medio y Bello Oriente.
Nuestra Señora de la Asunción, Sabalito Distrito: Sabalito Poblado: Sabalito La parroquia abarca la gran mayoría del distrito de Sabalito, y una pequeña parte de Gutiérrez Braun, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: Sector Sabalito: Sabalito, San Antonio, San Bosco, Santa Rosa, Santa Teresa, Brasilia, San Marcos, La Unión, San Ramón, Pueblo Nuevo y Valle Hermoso. Sector San Luis: San Luis, San Miguel, Río Marzo, Alpha, La Flor del Roble y Porto Llano. Sector La Lucha: La Lucha, Las Mellizas, San Francisco, La Aurora, La Esmeralda y El Progreso.
Patriarca San José, Fila Guinea Distrito: Gutiérrez Braun Poblado: Fila Guinea La parroquia abarca la totalidad del distrito Pittier, y la gran mayoría de Gutiérrez Braun, y organiza sus filiales en los siguientes sectores: Sector Fila Guinea: Fila Guinea, Monterrey, Fila Méndez, Fila Naranjo y Las Marías. Sector Santa Elena: Santa Elena, Agua Caliente, Fila Tigre, Palmira, Kamakiri, Santa Fe, Sancy y Pitier. Sector La Administración: Administración, San Rafael, Pinar, El Roble, San Carlos y La Libertad.
Vicaría San Juan Diego Ubicación: Provincia: Puntarenas Cantón: Buenos Aires
Está conformada por las siguientes parroquias: