La educación en el territorio de la actual república de Honduras, según la historia, se inició desde periodos precolombinos con la cultura Maya, la cual se basaba en estudios con matemáticas, astronomía, música, arquitectura, un sistema de escritura (jeroglífica) y la gastronomía a base de maíz, frutas y pescado; arquitectura y un sistema de escritura.
Durante la conquista y luego colonización española, la educación cambió radicalmente, ya que fueron los frailes misioneros los primeros encargados en propagar tanto el cristianismo, como luego la implementación del idioma español y la traducción, construyéndose escuelas dirigidas particularmente para criollos e hijos de peninsulares en un comienzo. En el y con la formación y creación del Estado de Honduras en 1821, se crearon las primeras escuelas de letras, asimismo la primera escuela militar en 1831 y una prueba de universidad desde 1845 hasta su formación oficial en 1847.
En la Constitución de Honduras de 1982 emitida mediante Decreto n.º 131 de Asamblea Nacional Constituyente y publicada en el Diario oficial La Gaceta se declara a la educación como derecho de todo hondureño.
En 1502 es la llegada de Cristóbal Colón a las costas hondureñas, fundándose así el lugar de Punta Caxinas, hoy Trujillo. Luego de este episodio, los conquistadores y colones españoles se apoderarían del territorio, trayendo consigo a los sacerdotes, freiles y monjes de las órdenes Franciscanas, Jesuitas y Mercedarias con el fin de evangelizar a los pueblos indígenas y darles educación básica, enseñándoles el idioma (castellano) español.
En 1540, el rey de España, Carlos I, envía una carta al Gobernador de Honduras ordenándole que establezca una hora y lugar en cada uno de los poblados de la provincia para que los indios se instruyesen en la doctrina católica. Atento a las órdenes reales, Cristóbal de Pedraza, obispo de Honduras, funda la primera escuela en el territorio en el pueblo de Gracias a Dios -hoy en día Gracias, Lempira-, en el año de 1547. En 1564, Fray Geronimo de Corella, otro obispo de Honduras, funda el primer colegio en la provincia, junto a una cátedra de gramática. Tanto la escuela de Pedraza, como el colegio de Corella, eran instituciones religiosas dedicadas a enseñar a los nativos las doctrinas católicas y costumbres europeas y aunque se tratasen de iniciativas de individuos, respondían a las políticas evangelizadoras de los indios que promulgaba la corona española.
El presentaría un avance significativo en la consolidación de las instituciones educativas en la provincia de Honduras. Parte de esta iniciativa estaría impulsada por una cédula de Felipe II, en la cual ordenaba a sus súbditos coloniales apegarse a lo dictado por el Concilio de Trento y fundar colegios seminarios para el entrenamiento de sacerdotes; esta ley fue expedida el 2 de junio de 1592 y posteriormente codificada en la Ley I, del Título XXIII, del Libro I de la Recopilación de las Leyes de las Indias. Respondiendo a esta nueva política, el Rey de España ordena a Alonso Criado de Castilla, presidente de la Audiencia de Guatemala, fundar una cátedra de gramática en el sitio de la catedral de la provincia de Honduras (Comayagua), recayendo esta responsabilidad sobre Gaspar de Andrada, el obispo.
Las instituciones de educación superior en la Audiencia de Guatemala iniciarían su curso con la fundación del Colegio de San Lucas en 1646. En esta institución estudiaría un religioso hondureño llamado Juan Cerón, quien desarrollaría su carrera docente en importantes instituciones educativas mexicanas. En 1676, se funda la Universidad de San Carlos de Borromeo, centro de enseñanza superior por excelencia en la Audiencia de Guatemala. En 1679, la Real Audiencia de Guatemala, ordena a los obispos de Honduras y Nicaragua fundar un colegio seminario en la ciudad en donde estaba asentada su catedral, concretándose esto con la creación del Colegio Seminario de San Agustín en ese mismo año, posteriormente llamado Colegio Tridentino de Comayagua.
En el , la dinastía de los monarcas Borbones darían un fuerte impulso a la educación, ordenando que en todas sus provincias se fundasen escuelas de primeras letras. En Honduras, las primeras escuelas de primeras letras comenzarían a aparecer a finales del siglo, en la década de 1770.
En 1779 es fundada la primera escuela en la Villa de san Miguel de Heredia de Tegucigalpa.
Siglo XIX A pesar de las constantes ordenanzas de los monarcas españoles por establecer escuelas de primeras letras, la condición económica de la provincia de Honduras evitaba que los centros educativos funcionasen efectivamente. Un ejemplo de esto es cuando Juan Antonio de Tornos rinde su informe anual a la corona en 1816, declarando que no había encontrado escuela de primeras letras en funcionamiento y que él había fundado uno de acuerdo a las reales órdenes. Ese mismo año, Narciso Mallol, el alcalde mayor de Tegucigalpa, recibe provisión del Rey de España ordenándole que funde una escuela de primeras letras, al no existir una en esa jurisdicción.
En 1821, Honduras y los demás países centroamericanos declaran su independencia del Imperio Español y meteóricamente se unen al Imperio Mexicano de Agustín de Iturbide; seguidamente se conforman como una Federación de Estados Centroamericanos y luego, en 1822, se declaran Estados independientes. En el mismo año, Dionisio de Herrera es electo como el Primer Jefe Supremo del Estado de Honduras. Herrera había sido graduado de Abogado por la Universidad de San Carlos de Borromeo en Guatemala. Los destinos de los hondureños estaban posteados en la Primera Constitución Política, en la cual basaba que la educación era un derecho.
En la Constitución de la República Federal de Centroamérica de 1824 se establecía en el artículo 69, del Título 4, que era responsabilidad del Congreso Federal dirigir la educación y dictar sus políticas. Posteriormente, en la Constitución del Estado de Honduras de 1825, se le otorga el destino de la educación al poder legislativo.
Francisco Morazán Quezada, presidente de la República Federal de Centroamérica de 1830 a 1838, emitió varios decretos en los cuales plasmó su pensamiento acerca de la educación. En decreto del 9 de junio de 1830, Morazán consideró que el objetivo de la educación pública debería de ser formar a los ciudadanos de la república para que estos dirigiesen el Estado de la mejor manera; mientras que en decreto del 1 de marzo de 1832, planteó que la educación debía de ser en tres niveles: una primera para preparar al infante para su entrada a la sociedad, una segunda que preparase a la juventud para su vida civil y una tercera que habilitase a los hombres a ejercer profesiones.
Educación laica
En el artículo 24 de la Constitución Política de 1880 se establece que la educación sea laica, en tal sentido, separándose de la iglesia y poniéndose a disposición del Estado.
Escuela Militar de Honduras
Antes de la independencia de Honduras, no existían escuelas militares en el país, la primera lo hizo en 1831 y el Cuartel San Francisco pasa a ser sede de la primera Escuela Militar de Honduras, nombrándose como primer director al coronel Narciso Benítez, de nacionalidad colombiana. En ella se gradúa el general José Santos Guardiola, quien posteriormente sería presidente de Honduras, durante dos periodos presidenciales consecutivos hasta su asesinato en 1862.
Fundación de la Universidad El Cuartel San Francisco deja de ser la escuela militar en 1845 y pasa a ser la sede de la Sociedad del Genio Emprendedor y del Buen Gusto en Tegucigalpa, siendo nombrado el presbítero José Trinidad Reyes rector. La sociedad era una especie de centro de estudios superiores, se podría decir que una prueba para llegar a convertirse en una universidad.
El gobierno del General Coronado Chávez mediante Decreto elevó a la Sociedad del Genio Emprendedor y del Buen Gusto y pasó a llamarla Academia Literaria de Tegucigalpa.
Durante la administración del presidente Juan Lindo, quien mediante decreto funda la Universidad Central de Tegucigalpa, en 1847. Esta fue inaugurada en solemnes actos en la iglesia de San Francisco en Tegucigalpa, con presencia del presidente Lindo, el obispo de Honduras Monseñor Francisco de Paula Campoy y Pérez y el primer rector del alma mater el presbítero José Trinidad Reyes.
Entre los años de 1873 a 1874 el gobierno hondureño destinaba US$ 720 dólares a la educación, en su mayoría era a la Universidad Nacional.History of Honduras: The Development of an Independent Nation, 1838-99 (idioma inglés)
Un enorme paso en la educación en Honduras fue dentro de la "reforma liberal" implementada por el doctor Marco Aurelio Soto, debido a que entre 1877 a 1878, las Escuelas de primeras letras para niños a cuyo caso, escuelas primarias, aumentó de las existentes 274 a 309 a nivel nacional, y el número de alumnos pasó de 9,123 a 10,978. El de las escuelas para niñas pasó de 21 en el año de 1877 a ser 55 en 1878; incrementándose el número de alumnos en estos dos años de 812 a 2,093.Herrans. Anastacio, "Estado Sociedad y Lenguaje, La política lingüística en Honduras", 2.ª edición, Editorial Guaymuras, Tegucigalpa, MDC, Honduras; 2000 (páginas 191-194)
Antes de finalizar el , otro gobierno visionario del Doctor Marco Aurelio Soto, reorganiza la universidad central. Este manda a que se creen las facultades de Medicina y cirugía, de Farmacia y Derecho, entre otras, y cambia el nombre a Universidad Nacional de Honduras.Historia de la UNAHEl 3 de abril de 1879 funda la Universidad Nacional de Occidente, con asiento en Santa Rosa de Copán.
Centros de educación fundados en el 17 de marzo de 1857: La Municipalidad de Tegucigalpa, cede el viejo Convento de la Merced para que funcione la Universidad Nacional de Honduras, es abierta la carrera de Derecho. 1861: Se funda una Universidad en Juticalpa, Olancho en la que el rector es el licenciado Santiago Cerna Cerrato.Euceda Roque, Darío. Colegio La Fraternidad, 1897-1997, Juticalpa, Olancho: atalaya cultural del siglo (su historia). (página 3) 1865: Mediante artículo n.º 24 de la Constitución Política de 1865 siendo presidente el General José María Medina Castejón se ordena la creación de las Escuelas Primarias de Educación Integral. Es de hacer mención que las escuelas eran de varones y de niñas, no mixtas. 1866: Abre sus puertas el Colegio San Norberto en Trujillo bajo la dirección del señor Manuel Fleury. 22 de diciembre de 1867: Es fundado en Tegucigalpa, el Liceo de Nuestra señora de Guadalupe siendo el director el Licenciado Mario Zanetti. 3 de agosto de 1869: Es fundado en La Paz el Liceo de Nuestra señora de La Paz bajo la dirección del Licenciado Julían Cruz. 8 de octubre de 1874: Es fundado mediante Decreto gubernamental el Instituto Científico de San Carlos en Santa Rosa de Copán, durante la presidencia de Ponciano Leiva, actualmente es el Instituto Álvaro Contreras. 1875: fundado el Instituto La Independencia en Santa Bárbara 13 de diciembre de 1877: Es ordenado la creación de Escuelas destinadas para la formación de señoritas, en un principio hubo dos, una contó con 79 alumnas y 38 en la otra, ambas con sistema "estadounidense" y con maestras extranjeras, como la señorita Mary Lester. 1878: Fundado el Instituto Central en la ciudad de Tegucigalpa. 1878: Se establece en la ciudad de Gracias una escuela filarmónica bajo la dirección del Profesor Hilario Hernández.
Entre 1878 a 1884: Se ordenó la fundación de Escuelas Normales para la formación de maestros hondureños, en las ciudades de Tegucigalpa, Comayagüela, Choluteca, Danlí, Goascorán, Intibucá, Juticalpa, La Paz, Ocotepeque, Santa Rosa de Copán, Yoro.
3 de abril de 1879: Es fundada la Universidad Nacional de Occidente con asiento en Santa Rosa de Copán y siendo presidente de la república el Doctor Marco Aurelio Soto, su primer rector fue el Presbítero y Bachiller Jesús María Rodríguez Orellana. Esta Universidad contaba con las carreras de Derecho y Medicina.