La Universidad de Alcalá, Universidad Complutense o Universidad Cisneriana (Complutensis Universitas) fue la universidad que existió en la localidad española de Alcalá de Henares (perteneciente actualmente a la Comunidad de Madrid), desde su fundación por el cardenal Cisneros en 1499 hasta su traslado a Madrid en 1836. Durante los siglos y se convirtió en el gran centro de excelencia académica.Casado Arboniés M, Díez Torre AR, Ruiz Rodríguez JI. La Universidad de Alcalá hacia la ciudad del saber. Una experiencia académica secular. Alcalá de Henares: Universidad de Alcalá, Servicio de Publicaciones; 2013. ISBN 978-84-15834-02-1 En 1777, se la separó física y orgánicamente de su Colegio Mayor de San Ildefonso y pasó a denominarse Real Universidad de Alcalá, con sede en el antiguo edificio del Colegio Máximo de los Jesuitas de Alcalá de Henares. En 1836, la universidad se integró junto con las enseñanzas de los Reales Estudios de San Isidro y el Real Museo de Ciencias Naturales de Madrid en una única institución, creando así la Universidad Central de Madrid, que, con el paso del tiempo, se convirtió en la actual Universidad Complutense de Madrid.

En sus aulas enseñaron y estudiaron grandes maestros y hombres ilustres, como Antonio de Nebrija, Santo Tomás de Villanueva, Juan Ginés de Sepúlveda, san Ignacio de Loyola, Domingo de Soto, Ambrosio de Morales, Benito Arias Montano, Francisco Suárez, Juan de Mariana, Francisco Vallés de Covarrubias, Antonio Pérez, San Juan de la Cruz, Mateo Alemán, Lope de Vega, Francisco de Quevedo y Villegas, Pedro Calderón de la Barca, Melchor Gaspar de Jovellanos, Andrés Manuel del Río, Fray Diego Morcillo y Blas Ortiz, entre otros.

Antecedentes: Studium Generale (1293-1499) miniaturadeimagen|Privilegio promulgado por Sancho IV de Castilla para fundar los Estudios Generales de Alcalá de Henares (20/05/1293). El 20 de mayo de 1293, el rey Sancho IV de Castilla otorgó licencia al arzobispo toledano García Gudiel para crear un Studium Generale (Estudio General, como entonces se denominaban los estudios universitarios) en Alcalá de Henares, "con las mismas franquezas para los maestros y escolares, que estaban concedidas al Estudio General de Valladolid". Estos estudios, si bien de manera bastante modesta, pervivieron a través del tiempo hasta enlazar con la refundación cisneriana. El 17 de julio de 1459, el papa Pío II otorgó una bula, solicitada por el arzobispo Alonso Carrillo de Acuña, "para la erección de tres Cátedras de Artes y Gramática en este estudio de Alcalá" en unas casas contiguas al convento de San Francisco, después denominado de San Diego. Estas últimas cátedras, susbsistentes de aquel Estudio General del , fueron integradas por Cisneros en la "nueva" universidad.La herencia de la universidad medieval. Biblioteca Histórica Marqués de Valdecilla. Exposiciones. 500 años de la Bula Cisneriana. 13 de junio de 1999.

Cisneros, fundador de la Complutensis Universitas miniaturadeimagen|derecha|Cardenal Francisco Jiménez de Cisneros (1604), por Eugenio Cajés. miniaturadeimagen|Bula de Alejandro VI autorizando la fundación de la Universidad de Alcalá (1499). miniaturadeimagen|Constituciones originales en latín del Colegio Mayor de San Ildefonso (Francisco Jiménez de Cisneros, 22-01-1510). miniaturadeimagen |derecha |Constituciones de la Universidad de Alcalá, edición de 1627 en latín.

Cisneros, que había sido alumno del Estudio General, creó a partir de este la Complutensis UniversitasAsí se la denomina, como lugar de edición de la primera de sus grandes publicaciones, que además marcó un hito en la historia de la imprenta, la parte del Nuevo Testamento (1514) de la Biblia Políglota Complutense: «In hac praeclarissima Complutensi Universitate, de mandato & sumptibus... Francisci Ximenez de Cisneros...industria & solertia... Arnaldi Guilielmi de Brocario, 1514 mensis ianuarij». (Universidad Complutense o de Alcalá o Cisneriana) mediante tres bulas pontificias concedidas por el papa Alejandro VI el 13 de abril de 1499.El término «complutense» proviene del nombre del asentamiento romano que da origen a la actual ciudad de Alcalá de Henares: Complutum, que se supone proviene del término confluvium (donde confluyen los ríos); si bien es esta una hipótesis cuestionada (el primer asentamiento de Complutum se hallaba en alto, apartado de cauces fluviales). Complutense es, por tanto, el gentilicio de Alcalá.

Gracias a esta bula, el cardenal pudo fundar la institución, dotarla de todos los bienes materiales y económicos necesarios y se confirió oficialidad a los títulos expedidos por ésta. Con bastante antelación a la obtención de la bula pontificia, Cisneros había comenzado una vasta labor de compra de terrenos y construcción: la futura Civitas Dei, Ciudad de Dios, bajo un esquema innovador (el primer campus universitario ex-novo del mundo) que sería exportado a diferentes universidades.Muñoz Santos E. Cisneros. El Prelado Fundador de la Civita Sapientiae. Amor, dedicación y entrega del Cardenal Cisneros a Alcalá. Revista MEC-EDUPAZ. Marzo-septiembre 2023; XXIV.

La primera piedra del edificio se puso el 14 de marzo de 1501.González Ramos R. La construcción del Colegio Mayor de San Ildefonso y la Universidad de Alcalá (siglos XV-XVIII). En: Rivera Blanco J (coordinador). Arquitectura universitaria. Ciudades patrimonio mundial: II Simposio Internacional de Arquitectura Universitaria. Editorial Universidad de Alcalá; 2016. p.235-68. ISBN 978-84-16599-89-9 La primera promoción de estudiantes no comenzó sus estudios hasta el 18 de octubre de 1508, festividad de San Lucas. Entre los alumnos de esa promoción se encontraba Tomás García Martínez, posterior arzobispo de Valencia, conocido como Santo Tomás de Villanueva.González Navarro R. Fundación del Colegio Mayor de San Ildefonso y Universidad de Alcalá de Henares. En: Aulas y saberes: VI Congreso Internacional de Historia de las Universidades Hispánicas (volumen I). Valencia: Universidad de Valencia; 1999. p.479-96.

El proyecto educativo de Cisneros En el curso 1509-1510 ya funcionaban cinco facultades: Artes y Filosofía, Teología, Derecho Canónico, Letras y Medicina.Reseña histórica. Universidad Complutense de Madrid. La fundación cisneriana: el Colegio Mayor de San Ildefonso. Biblioteca Histórica Marqués de Valdecilla. Exposiciones. 500 años de la Bula Cisneriana. 13 de junio de 1999. El 22 de enero de 1510, Cisneros dotó a su fundación de las «Constituciones del Colegio Mayor San Ildefonso», normativa reguladora de todos los asuntos de la comunidad universitaria, donde se especificaban los derechos y deberes de sus miembros.Cabañas González MD. Constituciones de la Universidad de Alcalá, 1510. Alcalá de Henares: Centro Internacional de Estudios Históricos Cisnerianos; 2010.

Cisneros adecuó la universidad a la nueva época (la Edad Moderna), fomentando su participación activa en la sociedad y en las estructuras de poder, sin ser solo un centro exclusivo para el cultivo erudito del saber, como había estado recluido dentro de los muros de los conventos medievales. La creó con tres objetivos:La antigua Universidad de Alcalá. Conoceréis la Verdad. 11 de diciembre de 2011. religioso: institución de enseñanza para formar eclesiásticos que recuperasen los valores de la espiritualidad antigua perdidos durante el Medievo; político: la formación de cualificados letrados y obispos a las estructuras de gobierno, capaces de dirigir los complejos asuntos de la Monarquía Católica; cultural: la adecuación de la teología a los principios de la antigüedad clásica.

Los dos principales cargos de la Universidad eran el de rector, elegido entre los alumnos del Colegio Mayor de San Ildefonso, siendo la persona con máxima autoridad académica, ejecutiva, económica y jurisdiccional; y el canciller, asignado de forma vitalicia al abad de la Iglesia Magistral de los Santos Justo y Pastor, que otorgaba los grados académicos universitarios por la autoridad apostólica que ostentaba. Cargos con numerosos enfrentamientos a lo largo de toda la historia de la institución.Delgado Calvo F. Abades Complutenses (que ocuparon el oficio de Canciller universitario) 1508-1832. Alcalá de Henares: Institución de Estudios Complutenses; 1986. ISBN 84-398-6610-0

El plan de estudios de la Universidad de Alcalá la convierte en el estandarte del humanismo cristiano. La Teología fue el eje central de la formación, siendo subsidiarias el resto de disciplinas: Derecho canónico, Filosofía, Medicina, Gramática, Retórica y las lenguas bíblicas. La Facultad de Teología organizó sus tres principales cátedras atendiendo a las tres escuelas más importantes de enseñanza teológica del europeo: escotismo, nominalismo y tomismo. Su magisterio se impartía en igualdad de condiciones, dotando a los alumnos de la posibilidad privilegiada, en tierras hispanas, de recibir una formación teológicamente amplia, sincrética y contrastada, sobre la base de la propia multiplicidad de los postulados defendidos.Laura Fernando García. Nuevos tiempos para lo clásico: la recepción de la tradición cultural de la Antigüedad en la Universidad Complutense cisneriana. Res Publica Litterarum. Suplemento monográfico “Tradición Clásica y Universidad”. 2008.

La organización de la Universidad La estructura organizativa de la Universidad de Complutense se componía de: el Rector era la persona con máxima autoridad académica y jurídica. Era, también, el rector del Colegio Mayor de San Ildefonso al ser elegido anualmente entre sus colegiales becados, y a su vez lo era de toda la Universidad de Alcalá, es decir, de todos los colegios menores adscritos. Los colegios menores también elegían a su rector (en la práctica era un vicerrector) entre sus colegiales becados.Breue discurso y apuntamiento iuridico, en que el Rector, y Colegio Mayor de San Ildefonso, Vniuersidad de Alcalà, representa la iusticia que dicho Rector tiene, en la competencia de iurisdiccion, con el Vicario Eclesiastico de dicha ciudad, y los iustificado motiuos que ha tenido, para hazer a dicho Vicario causa de perturbador de la iurisdiccion academica. Alcalá de Henares: Colegio Mayor de San Ildefonso; 1710. el Canciller o cancelario era la persona encargada de entregar los títulos académicos universitarios. Este cargo vitalicio le correspondía siempre al abad en la Iglesia de los Santos Justo y Pastor de Alcalá de Henares, por lo que ostentaba el título de "Magistral". las capillas eran un órgano de gobierno colegiado. Se celebraban periódicamente tanto en el colegio mayor como en los menores, con el fin de tratar los asuntos fundamentales como la elección del rector y de los tres consiliarios, el nombramiento de los oficiales del colegio y la presentación de informes sobre el estado de la hacienda y de los pleitos.Sotelo Martín ME. La Universidad Complutense en Alcalá y su Archivo Histórico (ss. XVI-XIX). Tesis doctoral. pp.92-4. los claustros eran un órgano colegiado específico de la universidad, que atendía todos los asuntos cotidianos que afectaban a esta institución.

Además, existían diferentes categorías de "oficiales" con tareas muy concretas:Sotelo Martín ME, Pacheco Sampedro R. La política archivística de la Universidad de Alcalá durante los siglos XVI al XIX. Una aproximación a su estudio. En: Cruz Mundet JR (editor). Archivos universitarios e historia de las universidades. Madrid: Universidad Carlos III de Madrid, Instituto Antonio de Nebrija de Estudios sobre la Universidad, Editorial Dykinson; 2003. pp. 301-16. ISBN 84-8155-641-6 asuntos de gobierno del colegio: secretario de la capilla, visitadores de los colegios menores e informantes. de la administración de la hacienda: receptor, ecónomo, diputados de cuentas, tesorero y mayordomos de diversas cuestiones materiales: la atención del refectorio, la limpieza y mantenimiento de los edificios, la asistencia médica, etc. obligaciones gubernativas: secretario de la Universidad y consiliarios