La Copa CECAFA de 1999 fue la edición número 23 del campeonato regional del África del Este.
Todos los partidos se jugaron en Kigali del 24 de julio hasta el 7 de agosto.
Información Tras el intento fallido de organizar el torneo en 1998, el Comité Ejecutivo de la CECAFA decidió que la Copa CECAFA de 1999 se realizara en .
Por primera vez, todos las selecciones afiliadas a la CECAFA participaron el certamen.
Grupo A EquipoPtsPldWDLGFGAGD4211041+34211020+20200216-5
Grupo B EquipoPtsPldWDLGFGAGD4211030+34211020+20200205-5
Grupo C EquipoPtsPldWDLGFGAGD4211020+222020110 Zanzíbar1201113-2
Grupo D EquipoPtsPldWDLGFGAGD 6220020+21201101-11201101-1
"Ruanda "B" terminó segundo por sorteo"
Cuartos de final
Semifinales
Tercer lugar
Final
Goleadores JugadorSelecciónGolesMaurice Sunguti3Abubakar Mukabwa2Hassan Mubiru2Nicholas Lewis2Shaban Daoudi2Faustin Gishweka2Thierry Hitimana1Nsefo Seku1Amoudi Katauti1Mohamed Said1Dieudonne Hategekimana1Mulualem Regassad1Tafesse Tesfaye1Abdallah Imantona1Nassor Ali 1Faisal Agab1Eric Omondi1Julian Nsegiyumva1Jimmy Gatete1Simeon Mulama1Bernard Muganika1Charles Kimiyu1Herbert Nsihizirungu1Juma Runyaneza1
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