miniaturadeimagen|350px|Plaza Independencia en 1746, aparece como "Plaza de toros de Avendaño". Durante el se transforma en un centro comercial y cultural. A partir de 1841, al establecerse un terminal de diligencias, se le conoce como "Plaza de las Diligencias". A medidos del diversos vendedores se asentaron en la parte sur de la plaza; esa porción terminó llamándose "Plazuela del Carbón". Con la erección del estado de Hidalgo y la construcción del Reloj Monumental cambia de nombre a "Plaza Independencia". De 1900 a 1990, experimentó diversos cambios entre remodelaciones principalmente y las construcciones que le circundan, han sido objeto de constantes cambios. En 1992 se construye la Pérgola Abundio Martínez. La remodelación más reciente es en 2015 con la construcción del Centro Cultural El Reloj.
thumb|350px|Plaza Constitución; en sus orígenes, se denominó Plaza Real o Plaza Mayor, por los españoles que la crearon en 1550. El 19 de marzo de 1813, se cambió el nombre de manera oficial, el nombre de la plaza se debe a la Constitución de Cádiz nombre dado por las autoridades de la Nueva España; la mayoría de la población le atribuye su nombre a la Constitución de 1857, o la Constitución de 1917.
thumb|350px|Plaza Juárez, surge al ser demolido el edificio de la estación del Ferrocarril Hidalgo, donde se construyó en 1957 la plaza. En ella se encuentra el Palacio de Gobierno del Estado de Hidalgo, el Teatro Hidalgo Bartolomé de Medina y el Jardín de los Hombres Ilustres; en esta plaza se coloca el árbol navideño de la ciudad y se da el grito de independencia por parte del gobernador del estado.
La historia de Pachuca de Soto data del , cuando fue fundada por un grupo mexica. La ciudad formaba parte de uno de los centros mineros más importantes de la Nueva España, ya que es aquí donde, por primera vez, se utilizó el método de amalgamación para la obtención de la plata, conocido como beneficio de patio.
Al inicio de la guerra de independencia las minas fueron abandonadas; en 1813, Pachuca recibe el título de Ciudad, mediante el pago de 3000 pesos que efectuó Francisco de Paula Villaldea. El 16 de enero de 1869, por decreto presidencial de Benito Juárez, se crea el estado de Hidalgo, designando como capital del estado a la ciudad de Pachuca.
De principios del , Pachuca de Soto y Mineral del Monte tuvieron un periodo de asociación con Cornualles, Inglaterra, la comunidad córnica e inglesa se estableció en la región, disminuyendo solamente durante la primera mitad del . Así, se organizaron y formaron un equipo, el "Pachuca Atletic Club", considerado uno de los primeros equipos oficiales de México, razón por la que a la ciudad se le conoce como la Cuna del Fútbol Mexicano.
Durante la etapa pos revolucionaria la historia, está ligada fuertemente a la minería; siendo dividida en tres períodos: el primero de 1920-1940, que oscila entre el estancamiento y la decadencia; el segundo de 1940-1965 que se mueve entre la decadencia y el repunte; y finalmente el período entre 1965-1990, que tuvo como característica el crecimiento minero. A partir del gran crecimiento que ha tenido la ciudad de 2000-2010, debido a la cercanía de la Ciudad de México, el crecimiento urbano comenzó a invadir otros municipios, ocupando zonas agrícolas y ejidales, creando la zona metropolitana de Pachuca.
En 2010 el Reloj Monumental de Pachuca cumplió 100 años de haberse construido, conmemoración que se llevó a la par con los festejos del Bicentenario de la Independencia Mexicana y el Centenario de la Revolución Mexicana. En 2011 fue declarado zona protegida por el Ayuntamiento de Pachuca; y en 2012 se declaró patrimonio artístico por parte del Instituto Nacional de Bellas Artes.
El 6 de noviembre de 2014 la ciudad fue declarada como “«Cuna del Fútbol Mexicano, Patrimonio Cultural Inmaterial del Estado de Hidalgo»”, por los integrantes de la LXII Legislatura del Congreso del estado de Hidalgo.
Periodo prehispánico Etapa lítica miniaturadeimagen|250px|Sierra de Pachuca, geológicamente pertenece a la subprovincia del Eje Neovolcánico, su formación es de origen ígneo extrusivo formado en la era cenozoica en el periodo terciario, con una edad aproximada de entre veinticinco y cinco millones de años.
En la Sierra de Pachuca, se han encontrado minas de obsidiana y un pequeño taller. Entre los hallazgos se encuentran restos de azadas, puntas de flecha, planos de forma trapezoidal que se empleaban en la explotación del maguey para obtener fibras textiles, utilizadas en la manufactura de ayates y cordeles, para lo cual también se emplearon malacates de barro. Algunos exploradores prehistóricos de la Sierra de Pachuca, pertenecieron a tribus nómadas que podrían ubicarse hacia 4500 a. C.
Periodo Preclásico
En el Período Preclásico mesoamericano, los primitivos cazadores y recolectores en Ixcuinquitlapilco, fueron sustituidos por grupos asentados en pequeñas aldeas dedicados a la agricultura. Las figurillas típicas de esta etapa, ya notaban evidencia que a partir de ese entonces la ocupación del área había sido continúa. La cerámica más abundante encontrada en esta zona, corresponde a ollas y cajetes con decoración negra, amarillo y roja, sobre blanco.
Una de las principales actividades en esta región, fue extraer y transformar la obsidiana, así también que una vez manufacturado, se intercambiaba con otros pueblos. La abundancia de cerámica negra sobre rojo pulido en cajetes, platos y vasos pulqueros, nos indica, por otra parte, influencias culturales del norte del Valle de México, principalmente de la región de Texcoco.
Periodo Clásico thumb|250px|right|El origen prehispánico de Pachuca es difícil de precisar, la ausencia de un glifo ha hecho caer en discusiones sobre su etimología. Oficialmente se reconoce al glifo de Pachuca, como una representación prehispánica que obedece a la topografía del lugar: Un cerro cortado por un río.
El Período Clásico mesoamericano; durante la primera parte de esta época, Mesoamérica será dominada por Teotihuacán. Los vestigios de la época teotihuacana (200 a. C. a 850 a. C.), en la región del municipio de Pachuca; son unas cuantas plataformas y figuras de barro encontradas en el Barrio de San Bartolo.
El área de la antigua Pachuca era de 2 km² a juzgar por la dispersión actual de los sitios arqueológicos, la ciudad era un paso obligado para llegar a las ciudades de Tulancingo, Tula de Allende y Atotonilco el Grande. Desde entonces procede, según las relaciones históricas, el descubrimiento de la metalurgia.
Periodo Posclásico 200px|miniaturadeimagen|El Acolhuacan en 1418, donde se aprecia la ubicación de Pachuca.
Del Período Posclásico mesoamericano proviene el inicio de la explotación de las minas de Xacal o Jacal y la que más tarde se conoció con el nombre de San Nicolás, las primeras en trabajarse a base de un viejo sistema llamado Torrefacción o Calcinación, que consistía en prender fuego a la veta, regularmente ubicada a poca profundidad, luego se le enfriaba bruscamente con agua para que se desquebrajara, pudiendo así la obtención de una buena proporción del metal.
En 1050 los otomíes se asientan en Njunthé, en la región de Pachuca, después cronológicamente, dominaron después los chichimecas cuyo centro religioso fue Xaltocan. En el año 1068 los mexicas en su peregrinación llegan a Zapotlán, lugar inmediato a Pachuca, donde permanecen cuatro años.
Del período Tolteca se dice ya explotaban las minas de la sierra de Pachuca, conocían las turquesas, sus minas de plata, oro, cobre y de estaño. También se encuentran varias edificaciones en San Bartolo y en Santiago Tlapacoya.
Posteriormente, los chichimecas de Xólotl fundaron el Señorío de Cuautitlán, supeditado a Texcoco, arrojaron a los otomíes al Valle del Mezquital mediante guerras sucesivas y consolidaron su dominio en la zona que llamaron "Cuauhtlalpan", dentro de la cual queda Pachuca. En 1174 pusieron los muros con sus señales en Pachuca, Citlatepec, Tlacotépetl y Yacatepétl. En 1181, vencieron a los Olmecas-Xicalancas en Xaltepec y a los Ayauhtecatl de Techimatli, posteriormente, en 1182 fijaron definitivamente sus linderos en Pachuca.
Después de la decadencia de Tollan-Xicocotitlan, los Chichimecas extendieron su dominio comprendiendo al actual municipio de Pachuca, el cual pasa a formar parte del señorío de Tulancingo, dependiente del reino de Acolhuacán. Para el año 1427 Pachuca, que pertenecía al reino de Acolhuacán, quedó sometida al imperio mexica, siendo rey de estos Itzcoatl. La región fue dividida en 1430 al concentrarse la triple alianza entre México-Tenochtitlan, Texcoco y Tacuba como la antigua Cuauhtlalpan.
En el año de 1438 la ciudad fue fundada definitivamente por un grupo mexica, de este periodo se encuentran un basamento prehispánicos ubicado en el Barrio Las Palmitas al pie del cerro de Cubitos. De esta época procede la explotación de la minas de Xacal y el Encino.
Conquista de México thumb|250px|left|Pintura del Lienzo de Tlaxcala donde se muestra la derrota de Señorío de Metztitlán frente a los conquistadores españoles y sus aliados tlaxcaltecas.
La Conquista de México se refiere principalmente al sometimiento del estado mexica, logrado por Hernán Cortés en el nombre del rey Carlos I de España y a favor del Imperio español entre 1519 y 1521. El 13 de agosto de este último año, la ciudad de México-Tenochtitlan cayó en poder de los conquistadores españoles.
De acuerdo al historiador Peter Gerhard, los españoles fueron vistos, por primera vez, en la región de Pachuca hacia 1519 y agrega que controlaron la región en 1521, aunque no hay evidencia histórica de tal afirmación.
De acuerdo con otra historia en 1528; Francisco Téllez apodado "El Tuerto", y veinticinco conquistadores españoles invadieron la región de Pachuca y mataron a su jefe Ixcóatl. Se apoderaron del cerro El Cuixi, y ante este acontecimiento Izcóatl, jefe de los indígenas preparó a su gente, pero Téllez, burló los movimientos del enemigo y lo dejó pasar de largo. Entonces, los españoles entraron a la población desprotegida y atacaron a las mujeres y niños que habían quedado en ella. Itzcóatl, retrocedió a defender su pueblo pero su ejército fue aniquilado y la ciudad incendiada.
Lo dicho anteriormente ha sido rebatido por algunos historiadores diciendo que la ocupación española es anterior a esa fecha; o quienes proponen fechas anteriores como 1524; y se basan en un documento que data del 28 de marzo de 1527, en el que se le hace merced de un solar en Pachuca como se deduce de lo asentado en el acta del Cabildo de la Ciudad de México:
Sin embargo en la "Relación de Méritos de Francisco Téllez", que obra en el Archivo General de Simancas en Simancas, España; y en la "Lista de pasajeros y conquistadores" de Boyd Bowman, no existe mención ni referencia alguna de la estancia de Téllez en la región. Y en el "Acta de Cabildo", que obra en el archivo del Ayuntamiento de la Ciudad de México; no se consigna en ningún párrafo el nombre de la ciudad de Pachuca, aunque el documento fue transcrito en varias obras histográficas, y fue alterado, aumentándose el nombre de la ciudad.
Virreinato de Nueva España
Surgimiento y evangelización de la ciudad thumb|left|250px|La Parroquia de la Asunción, esta parroquia fue de las primeras edificaciones de la ciudad.
La evangelización en la región empezó en 1528, llegan algunas misiones itinerantes de franciscanos, probablemente procedentes de Tulancingo y Tepeapulco; en seguida, se efectúa el arribo de los primeros sacerdotes del clero secular, quienes se encargarían de la jurisdicción religiosa de estos lugares.