thumb|right|250px|Vista de la abadía y la iglesia abacial thumb|right|250px|Iglesia abacial de San Germán. thumb|right|250px|Sala capitular de la abadía de San Germán. thumb|right|250px|La abadía en el , plancha grabado del ''Monasticon Gallicanum.

La abadía de San Germán, en Auxerre, es una abadía benedictina de Francia fundada en el por Germán de Auxerre.

La abadía data realmente del , cuando fue reconstruida bajo el reinado de Carlos el Calvo, que asimismo contribuyó a su sostenimiento. En ella se desarrolló una escuela que se convirtió en una de las más reputadas de la época y cuya influencia intelectual será esencial en el período del Renacimiento carolingio, gracias a maestros como Murethach, Haymon de Auxerre, Heiric de Auxerre (alumno de Loup de Ferrières) y Remi de Auxerre.

La abadía experimentó ampliaciones y renovaciones durante toda la Edad Media

Entre sus abades destaca el que sería papa Urbano V.

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