thumb|PEPWHEEL, una herramienta de EMBOSS, analizando la estructura proteica de una hélice alfa proteica. EMBOSS es una suite bioinformática de tipo open source creada por EMBnet que es empleada fundamentalmente en biología molecular y genética. EMBOSS es un acrónimo procedente del inglés «European Molecular Biology Open Software Suite». Se trata de un software versátil que recibe datos en multitud de formatos y que los analiza de múltiples maneras. Contiene multitud de herramientas centradas en el análisis de ácidos nucleicos y proteínas. Si bien se ejecuta en la línea de comandos, existen GUIs que facilitan su manipulación bajo un entorno gráfico.

Aplicaciones de EMBOSS GrupoDescripciónAcd Utilidades para archivos Acd Alignment consensus Obtiene secuencias consensoAlignment differences Encuentra diferencias entre secuenciasAlignment dot plots Comparaciones de secuencias tipo dot blotAlignment global Alineamiento de secuencias globalAlignment local Alineamiento de secuencias localAlignment multiple Alineamiento de secuencias múltipleDisplay Muestra secuenciasEdit Edita secuenciasEnzyme kinetics Calcula parámetros de cinética enzimáticaFeature tables Herramientas de anotaciónHMM Análisis de modelo oculto de MárkovInformation Ayuda general e informaciónMenus Interfaz de menúsNucleic 2d structure Estructura secundaria de ácidos nucleicosNucleic codon usage Uso de codonesNucleic composition Composición de nucleótidos de un ácido nucleicoNucleic CpG islands Detección de islas CpgNucleic gene finding Predicción de genesNucleic motifs Búsqueda de motivos en ácidos nucleicosNucleic mutation Mutación de ácidos nucleicosNucleic primers Predicción de cebadoresNucleic profiles Generación de perfiles de ácidos nucleicosNucleic repeats Detección de repeticiones en ácidos nucleicosNucleic restriction Análisis de restricciónNucleic RNA folding Análisis del plegamiento de ARNNucleic transcription Predicción de promotores, terminadores y factor de transcripciónNucleic translation Traducción de secuenciasPhylogeny consensus Métodos de filogenia por consensoPhylogeny continuous characters Métodos de filogenia por carácter continuoPhylogeny discrete characters Métodos de filogenia por carácter discretoPhylogeny distance matrix Métodos de filogenia por distanciaPhylogeny gene frequencies Métodos de filogenia por frecuencia génicaPhylogeny molecular sequence Análisis de secuencias y filogeniaPhylogeny tree drawing Dibujo de árboles filogenéticosProtein 2d structure Estructura secundaria de las proteínasProtein 3d structure Estructura terciaria de las proteínasProtein composition Composición de secuencias proteicasProtein motifs Búsqueda de motivos proteicosProtein mutation Mutación de proteínasProtein profiles Búsqueda en perfiles de proteínasTest Herramientas de prueba, no para uso generalUtils database creation Instalación de bases de datosUtils database indexing Indexado de bases de datosUtils misc Utilidades varias

Véase también Alineamiento de secuencias

Referencias

Enlaces externos Homepage of EMBOSS (en inglés) Homepage of EMBnet (en inglés) EMBOSS explorer - entorno web para EMBOSS

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