Atotonilco puede referirse a los siguientes lugares:
Poblaciones de México Estado de México San Pablo Atotonilco, localidad del municipio de Atlacomulco. Atotonilco (Estado de México), localidad del municipio de Ixtlahuaca.
Guanajuato Atotonilco (Guanajuato), localidad del municipio de San Miguel de Allende. Lugar donde se encuentra el Santuario de Jesús Nazareno.
Guerrero Atotonilco de Horcasitas, localidad del municipio de San Luis Acatlán.
Hidalgo Municipio de Atotonilco de Tula, municipio. Atotonilco de Tula, cabecera del municipio homónimo. Municipio de Atotonilco el Grande, municipio. Atotonilco el Grande, cabecera del municipio homónimo. San Francisco Atotonilco, localidad del municipio de Acaxochitlán. Atotonilco el Chico, antiguo nombre de «Mineral del Chico», cabecera del municipio de Mineral del Chico.
Jalisco Municipio de Atotonilco el Alto, municipio. Atotonilco el Alto, cabecera del municipio homónimo. Atotonilco el Bajo, localidad del municipio de Villa Corona.
Michoacán Atotonilco (Michoacán), localidad del municipio de Contepec.
Morelos Atotonilco (Morelos), localidad del municipio de Tepalcingo.
Sonora Atotonilco (Sonora), localidad del municipio de Bacún.
Tlaxcala San Antonio Atotonilco, localidad del municipio de Ixtacuixtla. San José Atotonilco, localidad del municipio de Tlaxco.
Otros Santuario de Jesús Nazareno de Atotonilco, iglesia del , considerada Patrimonio Cultural de la Humanidad por la UNESCO. Laguna de Atotonilco el Bajo, cuerpo de agua en el estado de Jalisco, México.