El Instituto de Investigaciones Históricas puede hacer referencia a las siguientes entidades académicas: Instituto de Investigaciones Históricas de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM); Instituto de Investigaciones Históricas de la Universidad Autónoma de Baja California (UABC); Instituto de Investigaciones Históricas de la Universidad Autónoma de Tamaulipas (UAT).