Las diócesis de la Iglesia del Oriente después de 1552 fueron las diócesis de la Iglesia del Oriente y sus ramas posteriores, tanto tradicionalistas (que finalmente se consolidaron como la Iglesia asiria de Oriente) como procatólica (que finalmente se consolidaron como la Iglesia católica caldea).
Diócesis de la línea Eliya, hasta 1700 thumb|right|240px|Monasterio Rabban Hormizd, residencia de la línea Eliya de patriarcas
El patriarca tradicionalista Shemʿon VII Isho ʿyahb (1539-1558), que residió en el monasterio Rabban Hormizd, consagró a dos metropolitanos, Isho ʿyahb para Nísibis, nominalmente con jurisdicción también sobre Amida y Mardin, y José para Gazarta. Isho ʿyahb probablemente no pudo ejercer su autoridad en Amida y Mardin, las cuales tenían metropolitanos católicos, pero José parece haber sido aceptado en Gazarta. El sobrino de Sem 'on, Eliya, permaneció como metropolitano de Mosul y natar kursya, y de los distritos de Mosul y Amadiya sin duda permanecieron leales a Semʿol VII.
La jerarquía de Eliya VI (1558-1591) El patriarca Eliya VI (1558-1591) tenía una jerarquía de al menos seis obispos: su hermano Hnanishoʿ, metropolitano de Mosul y natar kursya; Yahballaha, metropolitano de Berwari; Joseph y Gabriel, obispos de Gazarta; Ishoʿyahb, metropolitano de Nísibis, y Yohannan, metropolitano de Urmía. Mosul era la principal ciudadela tradicionalista, y Leonard Abel comentó en 1587 que aunque Sulaqa y sus tres sucesores habían sido todos patriarcas consagrados "de Mosul", ninguno había podido arrebatar la ciudad a sus rivales tradicionalistas. Entonces se convirtió en costumbre en el patriarcado de Mosul que el natar kursya del patriarca también fuera metropolitano de Mosul.
La jerarquía de Eliya VII (1591-1617) Según el informe de 1610, Eliya VII tenía seis metropolitanos (Eliya de Amida, Gabriel de Hesna d'Kifa, Ya ʿqob de Nísibis, José de Gazarta, Hnanishoʿ de Mosul y el natar kursya Shemʿon), y nueve obispos (Denha de Gwerkel, Yohannan de Abnaye, Ephrem de la diócesis de Atel de 'Ungi', Ishoʿyahb de Siirt, Yohannan de Atel, ʿAbdishoʿ de Salmas, José de Shemsdin, Abraham de Raikan y Abraham de 'las montañas'). Esta era una jerarquía considerablemente mayor que la que poseían sus predecesores, pero todos los metropolitanos y varios de los obispos están atestiguados en otros lugares, y no hay necesidad de dudar de su autenticidad. Algunas de las diócesis no se vuelven a mencionar, y al menos un obispo, Isho ʿyahb de Siirt, era sobrino y natar kursya de un metropolitano, para quien se tuvo que crear una diócesis ad hoc.
Otras fuentes mencionan a varios otros obispos en este período. A pesar de que los dos informes en gran medida se solapan, el informe de 1607 menciona varios obispos omitidos en el informe de 1610, incluyendo los metropolitanos 'Glanan Imech' de Sinyar, Sem 'on de Erbil, Denha de Lewun, Yahballaha de Van y Sem 'on de Albaq; y los obispos José de Nahrawan, Yohannan de 'Vorce', Yahballaha de Berwari y Abraham de Tergawar. El informe no mencionó sus lealtades, pero se sabe que Yahballaha de Berwari dependía de Eliya VII, y es probable que los metropolitanos de Sinyar y Erbil también estuvieran entre su jerarquía. Los metropolitanos Hnanishoʿ de Van y Abraham del distrito persa de 'Vehdonfores', probablemente el obispo de Tergawar mencionado en 1607, estuvieron presentes en el sínodo de Amida de Eliya VII en 1616.
Las jerarquías Eliya VIII (1617-1660) y Eliya IX (1660-1700) Eliya VIII (1617-1660) no consagró obispos para las históricas diócesis de Erbil, Nísibis y Hesna d'Kifa, probablemente porque sus comunidades siríacas orientales ya no eran lo suficientemente grandes como para necesitar un obispo, y durante su reinado el patriarcado de Mosul consistió de seis diócesis metropolitanas: Amida, Mardin, Gazarta, Siirt, Mosul y Salmas. Aunque mantuvo una correspondencia cordial con la Santa Sede de Roma, no estaba dispuesto a abandonar la fórmula cristológica tradicional nestoriana. Como Sem 'on X tenía reservas similares, las comunidades católicas en la Iglesia del Oriente se quedaron sin obispos católicos desde hacía varias décadas.
Diócesis de la línea Simón, hasta 1700 thumb|right|300px|El país de la Iglesia del Oriente: detalle de un mapa de 1721
La jerarquía de Simón VIII Yohannan Sulaqa (1552-1555) Se le dijo a Roma que los principales impulsores de la rebelión en 1552 contra el patriarca Shemʿon VII Ishoʿyahb eran los obispos anónimos de Erbil, Salmas y Adarbaigán, que fueron apoyados por muchos sacerdotes y monjes de Bagdad, Kirkuk, Gazarta, Nísibis, Mardin, Amida, Hesna d'Kifa 'y muchos otros lugares cercanos'; mientras que según Leonard Abel, escribiendo en 1587, el apoyo de Yohannan Sulaqa provino principalmente de las ciudades de Amida y Siirt y los distritos rurales vecinos. Se dice que Sulaqa consagró a cinco metropolitanos y obispos durante su breve patriarcado. Es casi seguro que eran los metropolitanos Eliya Asmar y ʿAbdishoʿ Maron, consagrados por Sulaqa para Amida y Gazarta, respectivamente, en 1554, el hermano de Sulaqa, José, consagrado para Siirt pero enviado poco después a la India, y los metropolitanos Gabriel de Hesna d'Kifa y Hnanishoʿ de Mardin.
La jerarquía de Abdisho IV Maron (1555-1567) Según Leonard Abel, ʿAbdishoʿ IV Maron 'creó muchos sacerdotes, obispos y arzobispos, y muchas ciudades de caldeos nestorianos anteriormente leales a su rival se colocaron bajo su autoridad'. Abel pudo haber obtenido esta impresión de una notoria carta que acompañó a una profesión de fe católica enviada por ʿAbdishoʿ al papa Pío IV en 1562. Esta carta, que sobrevive en tres traducciones latinas ligeramente diferentes de un original siríaco perdido, pretende contener una lista de treinta y ocho metropolitanos y obispos que reconocieron su autoridad:
El estatus de esta carta ha sido reconocido durante mucho tiempo como problemático, ya que el cuarto patriarca católico Shemʿon IX Denha tenía solo catorce obispos en 1580, y es poco probable que ʿAbdishoʿ tuviera una jerarquía mucho mayor varios años antes. Las ubicaciones de las catorce sedes metropolitanas enumeradas (con la excepción de Telkepe) tienen cierta plausibilidad, pero varias de las diócesis sufragáneas eran poco más que pueblos. Ninguno de ellos, hasta donde se sabe, había sido anteriormente la sede de un obispo, y los obispos que supuestamente tenían en 1562 no se mencionan en ninguna otra fuente. Es posible que ʿAbdishoʿ simplemente afirmó tener catorce diócesis (el mismo número que su sucesor), cuyos metropolitanos u obispos eran responsables de las diversas localidades enumeradas en cada metrópoli, y que el traductor malinterpretó su significado. Alternativamente, puede haber exagerado deliberadamente el tamaño de su jerarquía para impresionar a la Santa Sede. En cualquier caso, aunque quizás confirme la existencia de comunidades siríacas orientales en ciertos distritos y aldeas en este período e indique las áreas donde ʿAbdishoʿ reclamó apoyo, no se puede confiar en la carta como evidencia del número de obispos en su jerarquía.
Como guía para el apoyo de ʿAbdishoʿ, la carta debe tratarse con precaución. Su reclamo sobre los distritos occidentales (Amida, Mardin y Siirt tenían obispos católicos, y también controlaba los monasterios de Mar Pethion en el distrito de Mardin y Mar Yaʿqob el Recluso en el distrito de Siirt) era perfectamente razonable, y ciertamente tenía dos metropolitanos en la India. Su reclamo sobre los distritos de Erbil, Urmía y Salmas también puede haber sido justificado, en vista del apoyo a Sulaqa de sus obispos. Alqosh, sin embargo, era el bastión de su rival Shemʿon VII Ishoʿyahb, que también controlaba Telkepe y Karamlish. ʿAbdishoʿ tal vez se sintió obligado, como "patriarca de Mosul", a reclamar el distrito de Mosul, y pudo haber tenido un obispo nominalmente responsable de las aldeas de la llanura de Mosul.
Varios metropolitanos y obispos mencionados en otras fuentes pueden ser asignados plausiblemente a la jerarquía de ʿAbdishoʿ, y es interesante notar que sus diócesis coinciden con muchas de las diócesis metropolitanas enumeradas por ʿAbdishoʿ en 1562: el hermano de Sulaqa, José, metropolitano de Siirt, responsable también de la India desde 1555; Eliya Asmar, metropolitano de Amida de 1554 a 1582; Abraham, metropolitano de Angamaly en India; Hnanishoʿ, metropolitano de Nísibis y Mardin; el futuro patriarca Shemʿon VIII Yahballaha, metropolitano de Gazarta; Yohannan de Atel y Bohtan (Gwerkel de ʿAbdisho'), martirizado en 1572; el futuro patriarca Shemʿon IX Denha, metropolitano de Salmas, Siirt y Jilu; y Gabriel (y quizás su sucesor Sabrishoʿ ), obispo de Hesna d'Kifa.
La jerarquía de Shemon IX Denha (1581-1600) El cuarto patriarca católico Shemʿon IX Denha (1581-1600), bajo la presión de su rival nestoriano Eliya VII, abandonó los centros occidentales de Amida y Mardin que habían apoyado la unión con Roma, y gobernó su Iglesia desde el remoto monasterio de Mar Yohannan en el distrito de Salmas. Durante su vida conservó la lealtad de los obispos occidentales y fortaleció la jerarquía que había heredado al crear varias diócesis nuevas más allá de los distritos occidentales. Sus partidarios, mencionados en una carta de 1580 al papa Gregorio XIII poco después de su consagración, incluían no solo a los obispos occidentales Eliya de Amida, Hnanishoʿ de Mardin, José de Siirt, Yohannan de Atel y José de Gazarta, (antes leal a Eliya VI), pero también los metropolitanos José de Salmas, Sargis de Jilu, Hnanishoʿ de Shemsdin, ʿAbdishoʿ de 'Koma', tres hombres (dos llamado Denha y uno llamado Addaï) enumerados simplemente como metropolitanos, y el obispo Yohannan de 'Chelhacke'. 'Koma' era probablemente el monasterio de Mar ʿAbdishoʿ cerca de la aldea de Komane en el distrito de ʿAmadiya, mientras que 'Chelhacke' puede ser una deformación de Slokh (ܣܠܘܟ), el nombre siríaco de Kirkuk.
La jerarquía de Shemon X (1600-1638) La lealtad de varios distritos cambió drásticamente con la adhesión del patriarca protradicionalista Shemʿon X en 1600, quien dividió su residencia entre Salmas y Qodshanes. El retorno de Shem'on a la antigua fe fue bien recibido en algunos distritos, lo que le permitió consagrar obispos para los distritos Atel y Berwari, que anteriormente dependían de los patriarcas de Mosul. Por otro lado, los obispos occidentales traspasaron su lealtad al patriarca Eliya VII, principalmente porque se sentía más entusiasmado por la unión con Roma que su rival, pero quizás también porque no deseaban ser gobernados por un patriarca que no podía o no quería salir del remoto distrito de Salmas. Estos cambios dieron al patriarcado de Mosul el control de una amplia franja de territorio de las tierras bajas que se extiende desde Amida hasta Erbil, incluidas las ciudades importantes de Amida, Siirt, Gazarta, ʿ Amadiya, Mosul y Alqosh, mientras que Shemʿon X se quedó con los distritos montañosos de Bohtan, Berwari y Hakkâri, y el distrito de Urmía.
Según el informe de 1610, Shemʿon X tenía solo cinco metropolitanos (Hnanishoʿ de Shemsdin, Sargis de Jilu, Ishoʿyahb de 'las fronteras persas', Sabrishoʿ de Berwari y el natar kursya Addaï), y tres obispos (José de Urmía, Giwargis de Sat y ʿAbdishoʿ de Atel).
Las jerarquías de Shemon XI, Shemon XII y Shemon XIII El alcance de la jurisdicción de los patriarcas de la línea Simón durante el mandato de Shemon XI (1638-1656), Shemon XII (1656-1662) y Shemon XIII (1662-1700) se conoce a partir de pruebas fragmentarias, sin incluir la carta del 29 de junio de 1653 del patriarca Semʿon XI al papa Inocencio X: