thumb|300px|Arch Street Ferry, Filadelfia, donde se identificó el primer grupo de casos. La epidemia de fiebre amarilla de Filadelfia fue una epidemia que afectó a dicha ciudad en 1793, en donde fueron incluidas 5.000 o más personas en el registro oficial de defunciones entre el 1 de agosto y el 9 de noviembre. La gran mayoría de ellas murió de fiebre amarilla, lo que hizo que la epidemia en la ciudad de 50.000 personas fuera una de las más graves de la historia de los Estados Unidos. A finales de septiembre, 20.000 personas habían huido de la ciudad. La tasa de mortalidad alcanzó su punto máximo en octubre, antes de que las heladas acabaran con los mosquitos y pusieran fin a la epidemia en noviembre. Los médicos probaron diversos tratamientos, pero no conocían el origen de la fiebre ni sabían que se transmitía por los mosquitos —lo que no se verificó hasta finales del —.

El alcalde y un comité de dos docenas de personas organizaron un hospital para la fiebre en Bush Hill y otras medidas de crisis. La asistencia de la Free African Society fue solicitada por la ciudad y aceptada de inmediato por los miembros, basándose en la suposición errónea de que los nativos africanos tendrían la misma inmunidad parcial a la nueva enfermedad que muchos tenían a la malaria, la fuente más común de epidemias de fiebre durante los meses de verano.From Genetic resistance to malaria: Where this parasite [p. falciparum] is endemic, young children have repeated malaria attacks. [...] Repeated malaria infections strengthen adaptive immunity and broaden its effects against parasites expressing different to the good old immunity against malaria.(De Resistencia genética a la malaria: «Donde este parásito [p. falciparum] es endémico, los niños pequeños tienen repetidos ataques de malaria. [...] Las infecciones repetidas de malaria fortalecen la inmunidad adaptativa y amplían sus efectos contra los parásitos que se expresan de forma diferente a la buena y antigua inmunidad contra la malaria.») Las enfermeras de color ayudaron a los pacientes y los líderes del grupo contrataron a hombres adicionales para retirar los cadáveres, que la mayoría de la gente no tocaría. Los negros en la ciudad murieron al mismo ritmo que los blancos, unos 240 en total.

Algunos pueblos vecinos se negaron a dejar entrar a los refugiados de Filadelfia, por temor a que tuvieran fiebre. Las principales ciudades portuarias como Baltimore y Nueva York tenían cuarentenas contra los refugiados y los bienes de Filadelfia, aunque Nueva York enviaba ayuda financiera a la ciudad.

Comienzos En la primavera de 1793, llegaron refugiados coloniales franceses, algunos con esclavos, desde cabo Haitiano, Saint-Domingue (ahora Haití). Los 2.000 inmigrantes huían de la revolución haitiana de los esclavos en el norte de la isla. Abarrotaban el puerto de Filadelfia, donde en agosto comenzó la primera epidemia de fiebre amarilla en la ciudad en 30 años. Es probable que los refugiados y los barcos llevaran el virus de la fiebre amarilla y los mosquitos. El virus se transmite por picaduras de mosquitos. Los mosquitos se reproducen fácilmente en pequeñas cantidades de agua estancada. En 1793, la comunidad médica y otros no entendían el papel de los mosquitos en la transmisión de la fiebre amarilla y otras enfermedades.

En los puertos y áreas costeras de los Estados Unidos, incluso en el noreste, los meses de agosto y septiembre se consideraban la «estación enfermiza», cuando prevalecían las fiebres. En el sur, los plantadores y otras personas lo suficientemente adineradas solían abandonar el País Bajo durante esta temporada. Los nativos pensaban que los recién llegados tenían que someterse especialmente a un «condimento» y tenían más probabilidades de morir de lo que se pensaba eran fiebres estacionales en sus primeros años en la región.Currie, William, An Historical Account of the Climate and Diseases of the United States, Filadelfia: T. Dobson, 1792 Filadelfia era entonces la capital temporal de los Estados Unidos, y el gobierno debía regresar en el otoño. El presidente George Washington había abandonado la ciudad.

Las dos primeras personas que murieron de fiebre amarilla a principios de agosto en Filadelfia fueron inmigrantes recientes, uno de Irlanda y el otro de Saint-Domingue. Las cartas que describen sus casos se publicaron en un panfleto aproximadamente un mes después de su muerte. El joven médico enviado por los Superintendentes de los Pobres para tratar a la mujer irlandesa estaba perplejo y su tratamiento no la salvó.

Un libro de 2013 escrito por Billy G. Smith, profesor de historia en la Universidad Estatal de Montana, se argumenta que el principal vector de la plaga de 1793 en Filadelfia —y otros puertos del Atlántico— fue el buque mercante británico Hankey, que había huido de la colonia de Bolama — una isla situada frente a las costas de África occidental, la actual Guinea-Bisáu—, el mes de noviembre anterior, arrastrando la fiebre amarilla a todos los puertos de escala en el Caribe y la costa del Atlántico oriental.

Declaración de epidemia Después de dos semanas y un número creciente de casos de fiebre, Benjamin Rush, un estudiante de médico durante la epidemia de fiebre amarilla de 1762 en la ciudad, vio el tipo patrón: reconoció que la fiebre amarilla había vuelto. Rush alertó a sus colegas y al gobierno de que la ciudad se enfrentaba a una epidemia de «fiebre amarilla altamente contagiosa, así como mortal... biliosa y remitente». A la alarma se sumaba el hecho de que, a diferencia de la mayoría de las fiebres, las principales víctimas no eran los muy jóvenes ni los muy mayores. Muchas de las primeras muertes fueron de adolescentes y jefes de familia en las zonas portuarias.Butterfield, L. H., editor, Letters of Benjamin Rush, vol. 2, p 641. Creyendo que los refugiados de Saint-Domingue eran portadores de la enfermedad, la ciudad impuso una cuarentena de dos a tres semanas a los inmigrantes y sus bienes, pero no pudo hacerla cumplir ya que la epidemia aumentó en su extensión.

Entonces la ciudad más grande de los Estados Unidos, con unos 50.000 residentes, Filadelfia era relativamente compacta y la mayoría de las casas se encontraban a menos de siete manzanas de su principal puerto en el río Delaware. Las instalaciones de atraque se extendían desde Southwark, al sur de la ciudad, hasta Kensington, al norte. Los casos de fiebre se agruparon al principio alrededor del muelle de la calle Arch. Rush culpó a «algunos cafés dañados que se pudrieron en el muelle cerca de la calle Arch» por causar las fiebres. Pronto aparecieron casos en Kensington. Como el puerto era crítico para la economía del estado, el gobernador de Pensilvania, Thomas Mifflin, era responsable de su salud. Le pidió al médico del puerto, James Hutchinson, que evaluara las condiciones. El doctor encontró que 67 de los cerca de 400 residentes cerca del muelle de la calle Arch estaban enfermos, pero únicamente 12 tenían «fiebres malignas».American Daily Advertiser, 28 de agosto de 1793. Alarmado por lo que Rush y otros le dijeron, el alcalde Matthew Clarkson pidió a la sociedad médica de la ciudad, el Colegio de Médicos, que se reuniera y aconsejara al gobierno de la ciudad y a los ciudadanos cómo proceder.

Rush describió más tarde algunos de los primeros casos: El 7 de agosto, trató a un joven por dolores de cabeza, fiebre y vómitos, y el 15 trató a su hermano. El mismo día, una mujer a la que estaba tratando se puso amarilla. El 18 un hombre en el tercer día de fiebre no tenía pulso, estaba frío, húmedo y amarillo, pero podía sentarse en su cama. Murió unas horas después. El día 19 una mujer a la que Rush visitó murió en cuestión de horas. Otro médico dijo que cinco personas a la vista de su puerta murieron. Ninguna de esas víctimas era un inmigrante reciente.

El Colegio publicó una carta en los periódicos de la ciudad, escrita por un comité encabezado por Rush, sugiriendo 11 medidas para prevenir el «progreso» de la fiebre. Advirtieron a los ciudadanos que evitaran la fatiga, el sol caliente, el aire nocturno, el exceso de licor y cualquier otra cosa que pudiera disminuir su resistencia. El vinagre y el alcanfor en las habitaciones infectadas «no pueden ser usados con demasiada frecuencia sobre pañuelos, o en botellas con olor, por las personas cuyo deber llama a visitar o atender a los enfermos». Esbozaron medidas para los funcionarios de la ciudad: detener el tañido de las campanas de la iglesia y hacer que los entierros sean privados; limpiar las calles y los muelles; hacer explotar la pólvora en la calle para aumentar la cantidad de oxígeno. Todos debían evitar el contacto innecesario con los enfermos. Se enviaron tripulaciones para limpiar los muelles, las calles y el mercado, lo que animó a los que quedaban en la ciudad.Federal Gazette, 31 de agosto de 1793. Muchos de los que pudieron salir de la ciudad.

Elizabeth Drinker, una mujer cuáquera casada, mantuvo un diario durante años; su relato del 23 al 30 de agosto cuenta la historia acelerada de la propagación de la enfermedad en la ciudad y el creciente número de muertes. También describe las muchas personas que abandonan la ciudad.

Hospitales temporales thumb|Grabado del Hospital de Pensilvania: «El edificio por la generosidad del gobierno y muchas personas privadas se fundó con orgullo para el alivio de los enfermos y los miserables. Anno 1755.»William Strickland (arquitecto). 1811. Como todos los hospitales de esa época, el Hospital de Pensilvania no admitía pacientes con enfermedades infecciosas.

Los Guardianes de los Pobres se hicieron cargo de Bush Hill, una finca de 150 acres en las afueras de la ciudad, cuyo propietario William Hamilton estaba en Inglaterra para una estancia prolongada. El vicepresidente John Adams había alquilado recientemente la casa principal, por lo que los pacientes de fiebre amarilla fueron colocados en las dependencias. Se contrataron enfermeras para tratar a los pacientes, bajo las órdenes de jóvenes médicos de la ciudad, que debían visitarlos diariamente.

A finales de agosto no era tradicionalmente un momento de mucha actividad en la ciudad. Muchas familias que podían permitirse o que tenían parientes en el campo vivían en otros lugares durante ese mes caluroso. A partir de septiembre, los envíos generalmente aumentaban con la llegada de los productos de otoño de Gran Bretaña. En 1793, no estaba previsto que el Congreso Federal reanudara sus sesiones hasta noviembre, pero la Asamblea de Pensilvania se reunió en la primera semana de septiembre. Fundada por el cuáquero William Penn, la ciudad fue el centro de la vida cuáquera en los Estados Unidos. La reunión anual de la Sociedad de los Amigos estaba programada para la tercera semana de septiembre.

Pánico y refugiados Entre el asesoramiento del Colegio el 25 de agosto y la muerte del Dr. Hutchinson por fiebre amarilla el 7 de septiembre, el pánico se extendió por toda la ciudad; más gente huyó. Entre el 1 de agosto y el 7 de septiembre, 456 personas murieron en la ciudad; se informó de 42 muertes el 8 de septiembre. Se estima que 20.000 personas abandonaron la ciudad hasta septiembre, incluyendo a los líderes nacionales. El número de muertes diarias se mantuvo por encima de 30 hasta el 26 de octubre. El peor período de siete días fue entre el 7 y el 13 de octubre, cuando se contaron 711 muertes.

Algunos pueblos vecinos tenían patrullas en las carreteras para evitar la entrada de refugiados. Los principales puertos de Baltimore y Nueva York impedían la entrada de refugiados y los ponían en cuarentena a ellos y a las mercancías de Filadelfia durante semanas.

El editor Mathew Carey publicó un breve panfleto más tarde, en el otoño, en el que describía los cambios que habían ocurrido en la vida de la ciudad:

Enfermeras negras