thumb|right|250px| Carlos II, restaurado al trono de Escocia en 1660 La Restauración fue el regreso de la monarquía a Escocia en 1660 después del período de la Commonwealth, y los tres decenios siguientes de historia escocesa hasta la Revolución y la Convención de los Estados de 1689. Formaba parte de una restauración más amplia en las islas británicas que incluía el regreso de la dinastía Estuardo a los tronos de Inglaterra e Irlanda en la persona de Carlos II.

Como comandante militar de la mayor fuerza armada del Commonwealth, George Monck, gobernador general de Escocia, contribuyó a la restauración de Carlos II, que fue proclamado rey en Edimburgo el 14 de mayo de 1660. Hubo un indulto general por los delitos cometidos durante la Guerra de los Tres Reinos, pero cuatro individuos fueron exceptuados y ejecutados. Bajo el eventual acuerdo político, Escocia recuperó su sistema independiente de leyes, el parlamento y el kirk, pero también recuperó a los Señores de los Artículos y a los obispos, y ahora tenía un rey que no visitaba el país y gobernaba en gran parte sin referencia al Parlamento a través de una serie de comisionados. Estos comenzaron con el Conde de Middleton y terminaron con el hermano y heredero del rey Jacobo II, Duque de York. La restauración del Episcopado escocés llevó a una serie de conflictos entre los presbiterianos y los obispos del establecimiento episcopal, que culminaron en la persecución de The Killing Time.

Carlos murió en 1685 y su hermano el Duque de York le sucedió como Jacobo II de Inglaterra y VII de Inglaterra. Sobrevivió a intentos de rebelión, pero enajenó a gran parte de la nación política por su catolicismo y sus políticas. Cuando Guillermo II de los Países Bajos, yerno protestante de Jacobo, invadió Inglaterra en 1688, este huyó y Guillermo y su esposa tomaron el trono como Guillermo II y María II. Guillermo llamó a una Convención Escocesa, que estaba dominada por los presbiterianos. Ofreció a Guillermo y María la corona y, después de la derrota de los partidarios de Jacobo, los obispos fueron abolidos y un sistema presbiteriano fue reinstaurado en el kirk.

Las condiciones económicas de la época eran en general favorables, aunque la restauración de la independencia de Escocia restableció la frontera económica con Inglaterra y los aranceles ingleses. La restauración de la monarquía también supuso el restablecimiento de la nobleza en el poder político, aunque puede que ejercieran su poder con más cautela. También vio el aumento de los laicos, que continuaron ganando nuevos poderes políticos locales. Se intentó restaurar el teatro en Escocia, que había sufrido por la falta de una corte y la hostilidad del kirk. La Restauración vio la introducción de un estilo de casa de campo entre la nobleza escocesa que alentó un movimiento hacia una arquitectura más orientada al ocio. Al igual que en Inglaterra, la escultura estaba dominada por profesionales extranjeros. Escocia produjo algunos artistas notables y también fue visitada por muchos artistas continentales importantes. En el período comprendido entre 1679 y 1689 se fundaron muchas instituciones que serían importantes en la vida cultural e intelectual de Escocia. Antecedentes: Las guerras civiles y la Commonwealth thumb|left|200px|Los escoceses sujetan la nariz del joven Carlos II a la piedra de afilar del Compromiso, de un panfleto satírico en inglés En 1638, las reformas impuestas por Carlos I a la Iglesia de Escocia o kirk condujeron a las Guerras de los Obispos, la primera de una serie entre 1638 y 1651 conocida como las Guerras de los Tres Reinos. Los Covenanters tomaron el control del gobierno e inicialmente se mantuvieron neutrales cuando comenzó la primera guerra civil inglesa en 1642. Sin embargo, muchos escoceses estaban preocupados por las consecuencias de la victoria monárquica para el kirk y consideraban que la unión con Inglaterra era la mejor manera de asegurar su supervivencia. En octubre de 1643, el Parlamento inglés firmó la Liga y el Pacto Solemnes, que acordaron la unión a cambio del apoyo militar escocés.

Los monárquicos y moderados de ambos países rechazaron esto por motivos nacionalistas, al igual que los Independientes religiosos como Oliver Cromwell, que se oponían a cualquier iglesia ordenada por el estado. Los Covenanters y sus aliados ingleses consideraron que el New Model Army dominado por los Independientes era una amenaza mayor que los Realistas y cuando la Primera Guerra Civil terminó en 1647, negociaron para restaurar a Carlos al poder. A cambio, aceptó imponer el presbiterianismo en Inglaterra y suprimir a los independientes, pero se negó a convertirse en presbiteriano. Esto dividió a los Covenanters en Engagers, que estaban dispuestos a aceptarlo, y el Partido Kirk o Whiggamores, que no lo estaban. Después de la victoria de Cromwell en la segunda guerra civil inglesa, instaló el Partido Kirk como el gobierno de Escocia, que luego expulsó a los Engagers de la Asamblea General.

Esta alianza terminó con la ejecución de Carlos en enero de 1649; como los calvinistas, los Engagers y el Partido de la Iglesia consideraron la monarquía como algo divinamente ordenado, convirtiéndolo en un acto de blasfemia. En febrero, los escoceses proclamaron a Carlos II, Rey de Escocia y Gran Bretaña y en el Tratado de Breda (1650), acordaron restaurarlo al trono inglés. A cambio, aceptó el pacto y se vio obligado a repudiar una revuelta del líder monárquico Montrose, que fue capturado y ejecutado; Carlos nunca olvidó esta humillación.

Después de que la tercera guerra civil inglesaTambién llamada la Primera Guerra Anglosajona terminara con la derrota en 1651, Cromwell decidió que la única manera de garantizar la paz era destruir el poder del kirk y de la élite terrateniente escocesa. Parte de la solución fue hacer de Escocia parte de la Commonwealth de Inglaterra, Escocia e Irlanda, con representantes escoceses sentados en el Parlamento de Londres. La ratificación final de los términos se retrasó por los problemas de Cromwell con sus diversos parlamentos y la unión no se finalizó legalmente hasta 1657. Escocia estaba gobernada por una administración militar bajo el mando de George Monck, que consiguió imponer la ley y el orden y un cierto grado de tolerancia religiosa. Sin embargo, lo hizo utilizando jueces ingleses, en lugar de la ley escocesa, además de ser caro, lo que lo hizo impopular en ambos reinos.

A diferencia de Inglaterra, el 95% de los escoceses pertenecían al kirk y compartían la misma doctrina calvinista; el conflicto se centraba principalmente en el gobierno, y los vencedores expulsaban a sus oponentes. La Asamblea General se dividió entre los Resolutioners, que estaban dispuestos a readmitir a los antiguos Engagers y Realistas, y los Protestantes, que se negaron. Después de derrotar el levantamiento del Realista Glencairn en 1654, la administración del monje amplió deliberadamente las divisiones dentro del kirk; los efectos dominaron la vida política escocesa durante la Restauración y más allá, ya que los anteriormente expulsados volvieron al poder y excluyeron a sus oponentes.

Fin de la república y regreso de Carlos II thumb|El General George Monck, quien fue instrumental en la restauración de Carlos II Como comandante militar de la mayor fuerza armada de la Commonwealth, Monck fue fundamental en la restauración de Carlos II. Tras la muerte de Cromwell en 1658, Monck permaneció al margen de las maniobras políticas en Londres que condujeron al breve establecimiento de un régimen bajo el hijo del protector, Richard Cromwell, y tras su caída la subsiguiente lucha por el poder entre los líderes del ejército. Cuando esto demostró ser incapaz de producir un gobierno estable en 1659, Monck abrió negociaciones con Carlos II y comenzó una lenta marcha hacia el sur con su ejército. Después de llegar a Londres restauró el Parlamento largo inglés que había existido al principio de las guerras civiles. Este organismo, tras recibir algunas garantías de Carlos II, votó a favor de la restauración de la monarquía en Inglaterra y luego se disolvió. Esto creó una restauración de facto de la monarquía en Escocia, pero sin ninguna salvaguardia en cuanto a la posición constitucional del país. Los notables escoceses se encontraban en una posición débil en las negociaciones con la corona en cuanto a lo que sería el acuerdo. Carlos II dio a Monck el título de Duque de Albermarle en agradecimiento por su participación en la Restauración.

Carlos fue proclamado rey en Edimburgo el 14 de mayo de 1660 (por segunda vez: la primera fue más de diez años antes, el 6 de febrero de 1649). No fue coronado de nuevo en Escocia (habiendo sido coronado previamente en Scone en 1651). La Restauración "constituyó una ocasión de celebración y regocijo universal en toda Escocia". Carlos II convocó su parlamento el 1 de enero de 1661, que comenzó a deshacer todo lo que se había impuesto a su padre Carlos I. La Ley de Rescisión de 1661 hizo que toda la legislación que se remontaba a 1633 fuera «nula y sin efecto».

Indulto general y excepciones thumb|La ejecución de James Guthrie en Edimburgo, una de las cuatro excepciones al indulto general

El 9 de septiembre de 1662 el parlamento escocés aprobó la «Ley de indemnización y olvido». Se trataba de un indulto general para la mayoría de los tipos de delitos que pudieran haber cometido los escoceses, entre el 1.º de enero de 1637 y antes del 1 de septiembre de 1660, durante lo que la Ley llama los problemas tardíos, las Guerras de los Tres Reinos y el Interregno inglés. La ley se estructuró de manera similar a la «Ley inglesa de indemnización y olvido de 1660», legislaba un indulto general con excepciones, pero, al igual que la Ley de Gracia de Cromwell, contenía muchas más excepciones que la ley inglesa. La ley no anuló las disposiciones de ninguna ley anterior aprobada por el mismo Parlamento escocés ni las disposiciones del Comité de Sucesiones aprobadas desde agosto de 1660. Se mencionan explícitamente los decomisos de

Se aprobó una ley adicional denominada Ley que contiene algunas excepciones al acto de indemnización, que incluía fuertes multas para unos 700 antiguos adherentes al Pacto. La ley de excepciones especificaba que si una persona excluida no pagaba las multas en la fecha especificada él, todos eran hombres, perdería el beneficio del perdón general, pero al pagar a tiempo disfrutaría del beneficio del perdón e indemnización de Su Majestad a todos los efectos.

Algunos miembros del régimen anterior fueron juzgados y declarados culpables de traición. Algunos fueron ejecutados: Archibald Campbell, I marqués de Argyll, decapitado el 27 de mayo de 1661, James Guthrie y el capitán William Govan ahorcado el 1 de junio de 1661, y Archibald Johnston (Lord Warriston) ahorcado el 22 de julio de 1663. John Swinton (1621?-1679) fue condenado a la confiscación y encarcelamiento en el Castillo de Edimburgo, donde permaneció durante algunos años antes de ser liberado. En 1661 John Home de Kelloe tuvo sus propiedades secuestradas por estar con el ejército inglés contra el ejército del rey en la batalla de Worcester en 1651. Después de la Revolución Gloriosa de 1688 las propiedades fueron devueltas a su hijo George.

Asentamiento thumb|right|James Sharp, Resolutivo y luego Arzobispo, que fue asesinado en 1679

Bajo el eventual acuerdo político, Escocia recuperó su sistema independiente de leyes, el parlamento y el kirk, pero también recuperó a los Señores de los Artículos y a los obispos, y ahora tenía un rey que no visitaba el país y gobernaba en gran parte sin referencia al Parlamento a través de una serie de comisionados. Estos comenzaron con el Conde de Middleton y terminaron con el hermano y heredero del rey, Jacobo II de Inglaterra Duque de York, conocido en Escocia como el Duque de Albany.