derecha|miniaturadeimagen|333x333px|Catedral de Notre Dame de París.
Durante el , la Iglesia bizantina dirigida por Constantinopla continuó afirmando su autoridad universal. En el , esta aseveración se estaba volviendo cada vez más irrelevante a medida que el Imperio Romano Oriental se reducía y los turcos otomanos conquistaban la mayor parte de lo que quedaba del Imperio Bizantino (indirectamente ayudado por las invasiones del Oeste). Las otras iglesias de Europa oriental en comunión con Constantinopla no formaban parte de su imperio y actuaban cada vez más independientemente, alcanzando el estatus de autocéfalo y solo reconociendo nominalmente la posición de Constantinopla en la jerarquía de la Iglesia. En Europa occidental, el Sacro Imperio Romano se fragmentó, haciéndolo también menos imperio.
El alto escolasticismo y sus contemporáneos La escolástica originalmente comenzó a reconciliar la filosofía de los antiguos filósofos clásicos con la teología cristiana medieval. No es una filosofía o teología en sí misma, sino una herramienta y un método para aprender que pone énfasis en el razonamiento dialéctico. El propósito principal de la escolástica era encontrar la respuesta a una pregunta o resolver una contradicción. Es más conocida por su aplicación en la teología medieval, pero finalmente se aplicó a la filosofía clásica y muchos otros campos de estudio. derecha|miniaturadeimagen|300x300px|Santo Tomás de Aquino En el hubo un intento de supresión de varios grupos percibidos como heterodoxos, como los cátaros y los valdenses y el aumento asociado de las órdenes mendicantes (en particular los franciscanos y dominicos), en parte como una forma de alternativa ortodoxa a los grupos heréticos. Esas dos órdenes se convirtieron rápidamente en contextos para algunos de los teólogos escolásticos, produciendo teólogos tan "escolásticos" como Alejandro de Hales (franciscano) y Tomás de Aquino (dominico), o el franciscano Buenaventura de Fidanza. También hubo un florecimiento de la teología mística, con mujeres como Matilde de Magdeburgo que desempeñaron un papel prominente. Además, el siglo puede considerarse como un período en el que el estudio de la filosofía natural que podría denominarse anacrónicamente "ciencia" comenzó a florecer en manos de hombres como Roberto Grosseteste y Roger Bacon.
Los autores notables incluyen a
Santo Domingo de Guzmán Roberto Grosseteste Francisco de Asís Alejandro de Hales Matilde de Magdeburgo Roger Bacon
Buenaventura de Fidanza Tomás de Aquino Ángela de Foligno
Órdenes Religiosas occidentales Las órdenes monásticas, especialmente los benedictinos, cistercienses y premonstratenses, continuaron desempeñando un papel importante en la Iglesia católica a lo largo del . Las órdenes mendicantes, que se centraron en la pobreza, la predicación y otras formas de ministerio pastoral, se fundaron en ese momento. Las cuatro Órdenes Mendicantes reconocidas por el Segundo Concilio de Lyon son:
La orden de Predicadores (dominicos), fundada en 1215 por Santo Domingo de Guzmán. Los frailes menores (franciscanos), fundada en 1209 por San Francisco de Asís Los ermitaños de San Agustín (agustinos), fundados en 1256 cuando se unieron diferentes comunidades que seguían la Regla de San Agustín. La orden de Nuestra Señora del Monte Carmelo (carmelitas), que se fundó en Tierra Santa en el pero llegó a Europa en el .
Cruzadas La Cuarta Cruzada, autorizada por Inocencio III en 1202, tenía la intención de recuperar Tierra Santa, pero pronto fue subvertida por los venecianos que utilizaron las fuerzas para saquear la ciudad cristiana de Zara. Finalmente, los cruzados llegaron a Constantinopla, pero en lugar de seguir hasta Tierra Santa, los cruzados saquearon Constantinopla y otras partes de Asia Menor, estableciendo efectivamente el Imperio Latino de Constantinopla en Grecia y Asia Menor. Esta fue la última cruzada patrocinada por el papado; las cruzadas posteriores fueron patrocinadas por particulares. Así, aunque Jerusalén se mantuvo durante casi un siglo y otras fortalezas en el Cercano Oriente permanecieron en posesión cristiana durante mucho más tiempo, las cruzadas en Tierra Santa finalmente no lograron establecer reinos cristianos permanentes.
Sin embargo, las cruzadas contra los cristianos en el este por los cruzados católicos no eran exclusivas del Mediterráneo (véase también las Cruzadas del Norte y la Batalla del Hielo). El saqueo de Constantinopla y la Iglesia de la Santa Sabiduría y el establecimiento del Imperio latino como un intento aparente de suplantar al Imperio Bizantino Ortodoxo en 1204 se vio con cierto rencor hasta nuestros días. En el Este se vieron las acciones de Occidente como un factor determinante en el debilitamiento de Bizancio. Esto condujo a la conquista del imperio y su caída en manos del Islam. En 2004, el Papa Juan Pablo II publicó una disculpa formal por el saqueo de Constantinopla en 1204; la disculpa fue aceptada formalmente por el patriarca Bartolomé de Constantinopla. Muchas cosas que fueron robadas en ese momento: reliquias santas, riquezas y muchos otros artículos, todavía continúan en varias ciudades de Europa occidental, particularmente en Venecia.
Las cruzadas en el sur de España, el sur de Italia y Sicilia con el tiempo llevaron a la desaparición del poder islámico en estas regiones; los Caballeros Teutónicos expandieron los dominios cristianos en Europa del Este; y las cruzadas mucho menos frecuentes dentro de la cristiandad, como la cruzada albigense, lograron su objetivo de mantener la unidad doctrinal.Brian Tierney and Sidney Painter, Western Europe in the Middle Ages 300–1475. 6th ed. (McGraw-Hill 1998)
Cuarta cruzada 1202–1204 derecha|miniaturadeimagen|250x250px|Los estados cruzados se establecieron en Grecia después de la cuarta cruzada. La Cuarta Cruzada fue iniciada en 1202 por el papa Inocencio III, con la intención de invadir Tierra Santa a través de Egipto. Debido a que los Cruzados carecían de los fondos para pagar la flota y las provisiones que habían contratado de los venecianos, el Dogo Enrico Dandolo reclutó a los cruzados para devolver a la obediencia a la ciudad cristiana de Zara (Zadar). Debido a que posteriormente les faltaron provisiones los líderes cristianos decidieron ir a Constantinopla, donde intentaron colocar a un exiliado bizantino en el trono. Después de una serie de malentendidos y brotes de violencia, los cruzados saquearon la ciudad en 1204 y establecieron el llamado Imperio latino y una serie de otros estados cruzados en los territorios del Imperio bizantino griego. Esto se considera a menudo como el último punto de ruptura del Gran Cisma entre la Iglesia ortodoxa (Oriente) y la Iglesia católica (Occidente).
Después del saqueo de Constantinopla, gran parte de Asia Menor quedó bajo el dominio de la Iglesia católica y se estableció el Imperio latino de Oriente. Como la conquista de los cruzados europeos no fue exclusiva de la cuarta cruzada, se establecieron muchos reinos de gobierno europeo. Después de la caída de Constantinopla, en el Occidente latino se estableció el Imperio de Nicea, que luego fue el origen de la monarquía griega que derrotó a las fuerzas latinas de Europa y restableció la monarquía ortodoxa en Constantiopla y Asia Menor.
Cruzadas contra los ortodoxos orientales. miniaturadeimagen|275x275px|Los Caballeros Teutónicos en Pskov en 1240 como se muestra en Alexander Nevsky de Sergei Eisenstein (1938). Las cruzadas contra los cristianos en el este por los cruzados católicos no ocurrieron solamente en la cuarta cruzada. El saqueo de Constantinopla y de la Iglesia de la Santa Sabiduría, la destrucción del Monasterio de Stoudios, de la Biblioteca de Constantinopla y el establecimiento del Imperio latino en Constantinopla y también en toda Asia Occidental y Grecia (véase el Reino de Tesalónica, Reino de Chipre) sin embargo, se consideran definitivos. Esto se debe a la percepción de las atrocidades católicas que no son exclusivas de la ciudad capital de Constantinopla en 1204 a partir del período en el Este denominado Francocracia. El establecimiento del Imperio latino en 1204 estaba destinado a suplantar al Imperio Bizantino Ortodoxo. Esto está simbolizado en que muchas iglesias ortodoxas se convirtieron en propiedades católicas como la iglesia de Santa Sofía y la iglesia del Pantokrator, lo que se ve con cierto rencor hasta nuestros días. Algunos miembros de la comunidad cristiana europea apoyaron activamente el ataque de los cristianos orientales.
Esto fue precedido por un intento de conquista, apoyado por Europa, de Bizancio, Grecia y Bulgaria y otros países cristianos orientales que condujeron al establecimiento del Imperio Latino del Este y del Patriarca Latino de Constantinopla (con varios otros estados cruzados).
Los intentos de la Orden Teutónica de conquistar la Rusia ortodoxa (particularmente la República de Pskov y Novgorod), una empresa respaldada por el Papa Gregorio IX, también pueden considerarse parte de las cruzadas del Norte. Uno de los mayores golpes para la idea de la conquista de Rusia fue la Batalla del Hielo en 1242. Con o sin la bendición del Papa, Suecia también emprendió varias cruzadas contra el Nóvgorod ortodoxo. Muchos en el Este vieron las acciones de Occidente en el Mediterráneo como un factor determinante principal en el debilitamiento de Bizancio que llevó a la eventual conquista del imperio y su caída en manos del Islam."Fourth Crusade, 1202-1204" Even after Greek control of Byzantium was re-established, the empire never recovered the strength it had had even in 1200, and the sole effect of the fourth crusade was to weaken Europe's chief protection against the Turks.
Cruzada albigense miniaturadeimagen|320x320px|El Papa Inocencio III excomulgando a los albigenses (izquierda), masacre contra los albigenses por parte de los cruzados (derecha) La cruzada albigense comenzó en 1209 para eliminar a los cataros heréticos de Occitania (el sur de la Francia actual). Fue una lucha de una década que tuvo que ver con las preocupaciones del norte de Francia para extender su control hacia el sur como lo hizo con la herejía. Al final, los cátaros fueron exterminados y los partidarios de la independencia del sur de Francia fueron vencidos.
Después de que un legado papal fuese asesinado por los cátaros en 1208, el Papa Inocencio III declaró la cruzada albigense.Duffy, Saints and Sinners (1997), p. 112 Los abusos cometidos durante la cruzada causaron que Inocencio III instituyera informalmente la primera inquisición papal para prevenir futuras prácticas desviacionistas y para erradicar a los cátaros restantes.Vidmar, The Catholic Church Through the Ages (2005), pp.144-147Bokenkotter, A Concise History of the Catholic Church (2004), p. 132 Formalizada bajo el papa Gregorio IX, esta inquisición medieval ejecutó un promedio de tres personas por año cuando la herejía estaba en su apogeo.Norman, The Roman Catholic Church an Illustrated History (2007), p. 93 Con el tiempo, la Iglesia o los gobernantes seculares crearon otras inquisiciones para procesar a los herejes, para responder a la amenaza de invasión de los moros o con fines políticos. Se alentó a los acusados a retractarse de su herejía y aquellos que no lo hicieron fueron castigados con penitencia, multas, encarcelamiento, tortura o ejecución mediante quema.Black, Early Modern Italy (2001), pp.200-202Casey, Early Modern Spain: A Social History (2002), pp.229-230
La cruzada de los niños