thumb|200px|Troncal Eje Ambiental en los 2000 TransMilenio es un sistema de transporte de tipo BRT, que hace parte del sistema de transporte masivo de Bogotá y Soacha cuya entidad gestora es la Empresa de Transporte del Tercer Milenio S.A.

Su construcción se inició en noviembre de 1999https://www.eltiempo.com/archivo/documento/MAM-898669 y fue inaugurado el 4 de diciembre de 2000. Entró en operación comercial el 18 del mismo mes con las troncales (líneas) de la avenida Caracas (hasta la avenida de los Comuneros) y la calle 80. Desde entonces se han abierto nuevas troncales. Forma parte del SITP, junto con los servicios urbano, complementario y especial, que circulan por los barrios y vías principales de la ciudad.

thumb|200px|Artículado típico de la Fase II

Antecedentes thumb|right|Estación Los Héroes, aspecto interior|200px En la década de los años 1990, Bogotá afrontaba muchos problemas con su transporte público urbano. Los antiguos buses eran en su mayoría pequeños (máximo 60 pasajeros), antiguos (de máximo 20 años, algunos repotenciados de acuerdo a la normatividad de la época) y con muy poca exclusividad de vías frente al tráfico mixto para una ciudad que se acercaba a los siete millones.

Así el 4 de febrero de 1999 se decide crear el Sistema de Transporte Masivo del Tercer Milenio -TransMilenio-. Para lograr una adecuada estructuración del proyecto, que fuera exitoso y acorde con las necesidades locales, el gobierno distrital se apoyó en consultores de gran experiencia. Para la gerencia del proyecto contrató a la firma de consultoría internacional McKinsey y para la estructuración financiera a la firma de banca de inversión Capitalcorp S.A. Con la inversión financiada con un porcentaje de la sobretasa a los combustibles y los aportes del Distrito Capital y el Gobierno Nacional, se pudo dar inicio a este servicio. La construcción de la infraestructura y del sistema vial, y el mantenimiento de estos, los desarrolla el Instituto de Desarrollo Urbano de la ciudad (IDU).

Si bien el sistema se basó en la Rede Integrada de Transporte de la ciudad de Curitiba, se consideró innovador ya que a diferencia del sistema brasileño, en Bogotá se implementaron la puertas de accesos de pasajeros en el costado izquierdo de los buses, permitiendo que una sola estación operara en dos sentidos, así que si un pasajero se pasa sin querer de su estación de destino, puede tomar luego un bus en sentido contrario para devolverse, sin necesidad de pagar un pasaje adicional; además de estaciones con rampas de acceso y un gran uso de los puentes peatonales (muy tradicionales en la ciudad). En Curitiba, cada estación cubre un sentido y sus accesos no son con rampas sino con escaleras y plataformas eléctricas levadizas.

Fases y Licitaciones Fase I

thumb|200px|Portal 80 en los años 2000

En sus primeros días de prueba, el 18 de diciembre de 2000, TransMilenio inició principalmente la operación de manera gratuita con 21 estaciones de las cuales estaban comprendidas toda la troncal Calle 80 entre la estación de Cabecera de la Calle 80 hasta la estación sencilla Polo, incluyendo las estaciones intermedias Avenida Ciudad de Cali y Carrera 77, y las troncal de la Avenida Caracas con las estaciones: Tercer Milenio, Avenida Jiménez, Calle 19, Calle 26, Calle 45, Calle 57 y Temporal - Flores.

El 26 de diciembre de 2000, se habilitaron más estaciones de la troncal Avenida Caracas, las cuales fueron: Calle 22, Calle 34, Avenida 39, Marly, Calle 72 y Calle 76.

El 14 de febrero de 2001, entró la última estación pendiente de la troncal Avenida Caracas, Calle 63, quedando todo el tramo habilitado en su totalidad.

En el segundo trimestre del año 2001, en el mes de abril, el sistema TransMilenio comenzó a extenderse hacia el sur hasta la estación Restrepo y Olaya, más tarde el 12 de mayo de 2001 el servicio se extiende con la tercera troncal de la Autopista Norte desde la estación Héroes, la que funcionó durante un tiempo como fin de la línea hacia el norte. El 23 de junio de ese mismo año la troncal de la Avenida Caracas sur se extendió hasta la estación Molinos culminando el 6 de agosto con la puesta en marcha de la segunda cabecera del sistema conocida como el Portal Usme y la extensión de la troncal Autopista Norte con la puesta en marcha de las estaciones: Virrey, Calle 100, Pepe Sierra, Calle 127, Alcalá, Calle 146, Mazurén y Toberín.

El 18 de agosto de 2001 se habilitaron más estaciones de la troncal Autopista Norte: Calle 85, Calle 106, Calle 142 y Calle 161. El 25 de agosto de 2001 se habilita la penúltima estación pendiente de la troncal, Prado.

En el año 2002, el 2 de febrero, se inaugura la tercera cabecera conocida como el Portal Norte, y el 16 de febrero entra en operación el ramal del Tunal con las estaciones Parque, Biblioteca y la cuarta cabecera conocida como el Portal Tunal. En el segundo semestre de ese mismo año, en junio, se extendió el sistema a partir de la línea de la Caracas por la Avenida Jiménez hasta la estación Museo del Oro, y llegando al Centro Histórico de la ciudad con la estación Las Aguas en diciembre, finalizando así la primera fase del sistema.

Se adjudica por concesión a 12 años (originalmente) la operación de los vehículos así:

+Fase 1OperadorPatioFecha de IniciaciónFecha de TerminaciónS.I.T.M. S.A. Ciudad Móvil (Serie A)Portal Autopista Norte 18 de diciembre de 2000 30 de septiembre de 2019Express Del Futuro (Serie M)Portal Calle 80 18 de diciembre de 2000 15 de junio de 2019SI99 S.A. (Serie U)Portal Usme 18 de diciembre de 2000 30 de junio de 2019Metrobús (Serie T)Portal Tunal 26 de enero de 2001 15 de junio de 2019

Los Vehículos Alimentadores para los Portales Fase I fueron adjudicados originalmente así:

+Fase 1OperadorEstación (es)Codatermil Portal Usme y MolinosSidauto S.A. Granja – Carrera 77U.T. Uribe Uribe Calle 40 SurSidauto S.A. Portal 80Alcon Portal TunalAl Norte Portal Norte

Fase II thumb|Américas - Avenida Boyacá en la Troncal Américas.|left thumb|left|Estación Portal Norte. En 2002 se extendió el sistema a partir de la línea de la Caracas por la Avenida Jiménez, y llegó al Centro Histórico de la ciudad, con lo que finalizó la fase I proyectada del sistema y se dio inicio a la construcción de la fase 2.

El 27 de diciembre de 2003 se dio al servicio la troncal de la Calle 13 y la de la Avenida de Las Américas, con el corredor vial hacia la localidad de Kennedy, y quedó integrado al ramal del Eje Ambiental. En 2003 y 2004 se inauguraron las estaciones del Portal Américas y Banderas, y llegó a uno de los sectores más populosos de la capital colombiana.

El 28 de abril de 2004 una máquina recicladora de asfalto cayó desde el carril norte-sur al sur-norte en el sector de Vidrio Muran, sobre un bus escolar del Colegio Agustiniano Norte, que se desplazaba en sentido contrario, aplastándolo y quitando la vida a 21 estudiantes en su interior. Por causa de este incidente la estación del sistema más cercana al sitio del accidente se llama 21 Ángeles.

El 1 de julio de 2005, luego de año y medio de obras, se entregó la tercera troncal de la fase II, la línea de sobre la Avenida NQS, que se desprende de la troncal Autopista Norte a la altura de la calle 92 para unir con la estación Santa Isabel, en la Autopista Sur con carrera 51 en unos 50 minutos. Esta troncal extendió a la estación General Santander el 15 de septiembre del mismo año.

A partir del 13 de febrero de 2006, se dio al servicio el conector de la calle 80 con Autopista Norte, ya que durante la construcción de las troncales, el antiguo conector fue sellado y cubierto con grama y secciones de andén. Sin embargo, luego de varios años de trabajo que permitió construir de nuevo el conector, este no fue usado hasta la fecha citada por problemas de diseño.

Así, los articulados pueden desplazarse del occidente al norte y viceversa, evitando a los pasajeros tener que hacer un trasbordo en las estaciones Calle 76 y Calle 72, lo que logró descongestionar dichas estaciones.

El servicio con el que se inició era el expreso 140. Sin embargo debido a problemas de diseño que podían causar una elevada accidentalidad, el conector fue reconstruido en el año 2008

Fue dado al servicio nuevamente en enero de 2009, contando con un nuevo puente vehicular que segrega la calzada de los buses articulados del resto del tráfico, y la ampliación del túnel existente (para empalmar con el puente).

El tramo de la troncal de la avenida NQS, de la Escuela General Santander al Portal Sur, ubicado cerca al cementerio El Apogeo, entró en operación el 15 de abril de 2006, con los nuevos servicios expresos 150 y 160 y la extensión del servicio corriente 5.

La troncal de la avenida Suba fue puesta en servicio el 29 de abril de 2006 después de varios meses de demora en puntos claves de la troncal como lo son el intercambiador Suba-NQS-Calle 80 y el Alto de la Virgen. Se adjudica por concesión a 12 años (originalmente) la operación de los vehículos como se indica en la tabla. Así mismo los operadores deben asumir los costos de limpieza y seguridad privada en las estaciones de la fase II:

+Fase 2OperadorPatioFecha de TerminaciónTransmasivo S.A (Serie S)Portal Suba15 de enero de 2020Somos K S.A. (Serie K)Portal Américas29 de febrero de 2020Connexion Móvil S.A. (Serie B)Portal Sur29 de diciembre de 2023

Los Vehículos Alimentadores para los Portales Fase II fueron adjudicados así:

+Fase 2OperadorPatioFecha de TerminaciónUnión Temporal Alcapital Fase 2 Portal Suba 2021Etma Portal Américas 2014Si03 Portal Sur 2014Citimovil Portal Usme y Molinos 2014

Fase III thumb|Zona oriental de la troncal de la avenida Eldorado. thumb|Corferias en la Avenida Eldorado.|left En el 2012, se inauguró la Troncal Calle 26 (Avenida El Dorado), con la puesta en funcionamiento del Portal Eldorado y la estación Gobernación en su primera etapa. Luego, en octubre se puso en servicio la totalidad de las estaciones de la calle 26 y la carrera Décima.

En octubre de 2013 se anunció el inicio de operación de los buses duales (los cuales transitan tanto por carriles exclusivos como en tráfico normal) por la carrera Séptima, estos buses se detienen en los paraderos del carril exclusivo de la carrera décima hasta llegar a la estación subterránea de la estación Museo Nacional donde finaliza el carril exclusivo.

El 27 de diciembre de 2013, tras 7 años de construcción, se inauguraron cuatro estaciones en el municipio de Soacha al sur de la ciudad de Bogotá entre La Despensa y San Mateo, estas estaciones forman parte de la primera fase de construcción del sistema de transporte en el municipio de las tres proyectadas.

Ante la gran demanda y la rápida saturación que sufrió el servicio en el municipio, a solo tres meses de ser inaugurado, se hizo necesaria en marzo del 2015 la ampliación de las estaciones exceptuando la de la Despensa, adecuandolas para la operación de biarticulados. Simultáneamente para lograr la implementación del servicio de alimentadores fue necesaria la construcción de la estación integrada de San Mateo. La obra fue finalizada en diciembre del 2014 pero debido a desacuerdos entre TransMilenio y la alcaldía de Soacha no fue puesta en funcionamiento hasta 2016.

Se adjudica por concesión a 24 años (con renovación de la flota a la mitad del contrato) la operación de los vehículos así:

+Fase 3OperadorPatioConsorcio Express (Series D y N)Portal 20 de Julio (San CristóbalGMóvil (Serie E)Portal Engativa

El portal de Fontibón es adjudicado al operador Coobus, pero tal empresa solo pudo operar algunos meses y su contrato finalmente fue caducado por TransMilenio. Se adjudica por concesión a 24 años (con renovación de la flota a la mitad del contrato) la operación de los Vehículos Alimentadores así:

+Fase 3OperadorEstación (es)GMóvil (Engativá), Engativa (Portal Eldorado)Consorcio Express Portal 20 de Julio (San Cristóbal)