thumb|right|Francisco de Almeida fue el primer militar portugués en navegar por el puerto de Bombay en 1508
El dominio portugués sobre la región que actualmente ocupa Bombay, la capital financiera de la India y una de las ciudades más pobladas en el mundo, se inició en 1535 y terminó oficialmente en 1665; si bien algunas partes dejaron de ser administradas tiempo más tarde, en 1737. Cuando los marinos portugueses llegaron a la región situada en la orilla del mar de Arabia, donde ahora se levanta la ciudad, se encontraron con un archipiélago de siete islas. Entre el y el , dichas islas estaban bajo el control de las sucesivas dinastías hindúes. Fueron unidos en 1348 por el gobernante musulmán de Gujarat que ya controlaba hace décadas Vasai, lo que es hoy Tanna. Más tarde, entre 1391 y 1534, las islas formaban parte del Sultanato de Gujarat.
Debido a la creciente amenaza planteada por el poder del emperador mogol Humayun (1530-1556), el sultán Bahadur Shah de Gujarat (1526-1537)Badur Xá aparece en las crónicas portuguesas como rey de Cambaia se vio obligado a firmar el Tratado de Bassein con los portugueses en 23 de diciembre de 1534. En virtud de este tratado las siete islas de Bombay, la cercana ciudad estratégica de Vasai y sus dependencias se les ofrecieron a Portugal, acuerdo que se llevó a efecto el 25 de octubre de 1535. El archipiélago ha tenido varios nombres en portugués hasta que finalmente se estabilizó bajo el nombre de Mumbai. Durante el período portugués, las islas fueron arrendadas a varios funcionarios portugueses.
Los portugueses promovieron activamente el establecimiento y crecimiento de diversas órdenes religiosas católicas en Bombay. Los franciscanos y los jesuitas construyeron varias iglesias entre las que destacan la de San Miguel en Maim, la Iglesia de San Juan Bautista en Anderi, la de San Andrés en Bandora y de Nuestra Señora de la Gloria en Byculla. También se construyeron varias fortificaciones militares alrededor de la ciudad como el Castillo de Bombay, el Fuerte Bandra, ahora también conocido como Castella de Aguada, y el Fuerte Madh.
Desde el comienzo del hubo varios enfrentamientos con los británicos por la hegemonía sobre Bombay debido a la importancia estratégica del puerto natural y las defensas naturales contra los ataques por tierra. A mitad de ese siglo el poder creciente de Imperio neerlandés obligó al Reino Unido a encontrar otro emporio en la Indias Occidentales. El 11 de mayo de 1661, mediante el contrato de matrimonio de Carlos II (1660-1685) con Catalina de Braganza (1662-1685), hija del rey Juan IV de Portugal (1640-1656), se entregaba la posesión de Bombay al Reino Unido como parte del dote de Catalina de Braganza. La entrega del archipiélago a Inglaterra tuvo varios contratiempos y solo fue parcialmente eficaz en 1665. Aunque en 1667 los británicos ya habían tomado posesión de la mayor parte de las islas, algunas de ellas se mantuvieron durante varios años bajo el dominio portugués. La última posesión portuguesa en la región, la isla de Salsete, se acabó de perder en abril de 1737, cuando fue conquistado por los Marathas.
Llegada de los portugueses thumb|left|Ruinas de la iglesia de San Juan Bautista en Anderi, construida por los jesuitas portugueses en 1579
El archipiélago de las siete islas fue propiedad de dinastías hindúes sucesivas entre los siglos III a.C. y XIV d.C. Máurias lo fue hasta 185 a.C., Satavanas entre los años 185 a.C. 250 d.C., Abiras y Vakatakas desde 250 hasta principios del , Calachuris hasta el , Konkani Máurias entre el y comienzo del , Chaluquias a finales del , Rastracutas a mediados del , Silharas entre los años 810 y 1260, Iadavas desde finales del hasta 1348, los gobernantes musulmanes Gujarat entre 1348 y 1391 y, finalmente, el Sultanato Gujarat.
Cuando los portugueses llegaron a la región, que fue gobernada por el sultán Bahadur Shah de Gujarat (1526-1537)Badur Xá aparece en las crónicas portuguesas como rey de Cambaia y estaba compuesta por siete islas: Bombay, Colaba , Colaba pequeña o la isla de antigua o isla de la anciana, Main, Mazagaon , Parel y Varel. El grupo de islas Salsete estaba situado al este de Bombay y separadas por bahía Maim. Los lugares estratégicos cercanos a Mumbai fueron Bassein (Baçaim) al norte, Thana al este y Chaul al sur.
Los portugueses llegaron a la costa de la India por primera vez cuando Vasco de Gama desembarcó en 1498 en Calcuta, 1100 kilómetros al sur de Bombay. Varios años después de su llegada, los portugueses se esforzaron por consolidar su poder en el Konkan del Norte a partir de la construcción de una fortaleza en Goa que conquistó el sultán de Bijapur en 1510. El barco del virrey y explorador Francisco de Almeida entró en el puerto natural profundo de Bombay en diciembre de 1508, durante su expedición a Diu.
Expedición de Francisco de Almeida a Diu (1508) thumb|upright=0.5|Sultán mameluco al Ghawri
La expedición de Francisco Almeida en 1508 tenía como objetivo principal luchar contra la flota enviada por el sultán mameluco al-Ghawri, liderado por Mir Hoçaine, o Amir Huceine, con la orden de expulsar a los portugueses de la India. La flota de Francisco de Almeida, que constaba de 19 barcos con 1600 soldados, incluidos 400 procedentes del Malabar, dejó Cananor, más allá de la isla Anjadip en el sur de Goa, y alcanzó Dabul, a unos 250 km al sur de Bombay —que entonces era una ciudad muy próspera— el 30 de diciembre. El portugués arrasó y saqueó Dabul y la abandonó el 5 de enero de 1509 para dirigirse a continuación a Bombay, donde llegaron el 21 de enero con la intención de abastecerse.
Cuando llegaron, capturaron un barco tripulado por 28 guyarat —«moros» musulmanes— en la ribera de Bandorá. Como la carga de ese navío no era suficiente para abastecer a su flota, el portugués envió a algunos de los tripulantes de la nave capturada para pedir provisiones al gobernador de la isla de Bombay a cambio de dinero. El virrey mandó a algunos de sus hombres detrás de los emisarios con instrucciones para no causar daños innecesarios en la isla. Estos hombres desembarcaron cerca del fuerte de Maim, sin ser molestados, y se apoderaron de 24 carneros, que llevaron al margen de la ribera de Maim. Sin embargo, el gobernador local se había puesto en fuga hacia el interior, posiblemente hacia la isla de Bombay, junto a la mayor parte de los habitantes de Maim, pero envió 12 sacos de arroz y 12 cabras al virrey al que pidió disculpas por no enviar todo ya que indicaba que las plagas de langostas habían destruido todo en la isla. left|thumb|El Forte de Maim ya existía antes de que los portugueses tomaran posesión del archipiélago
El historiador portugués Gaspar Correia (ca. 1495-1561) presenta una versión diferente de esta parte de la expedición. De acuerdo con él, Francisco de Almeida partió de Dabul, pasó por Chaul, a 60 km al sur de Bombay, donde no entró para ahorrar tiempo y anclaron en Bombay, donde los nativos huyeron llenos de terror. Los portugueses tomaron posesión de un gran número de vacas y capturaron algunos «negros», después de haber hecho cautivos a los mejores y matado a los demás. Habiendo reparado en un «negro» amistoso, el virrey mandó liberarlo con la condición de que se comprometiera bajo juramento, de acuerdo con su ley, para llevar una carta al Din y entregársela a Malique Aiaz —Malik Ayaz—. Para el contexto se puede observar que Malique Aiaz fue probablemente el gobernador de Diu o un comandante militar que estaba estacionado allí. El nativo aceptó y de hecho la carta fue entregada a Malique Aiaz 20 días antes de que la flota llegara a Diu.
La expedición partió hacia Diu donde llegó el 2 de febrero de 1509. Malique Aiaz y Amir Huceine habían sido preparados para resistir el ataque esperado de los portugueses, a los que esperaban con una flota de 200 barcos. La lucha al amanecer y terminó con una contundente victoria de los portugueses, que saquearon barcos musulmanes. Amir Huceine fue gravemente herido y los estandartes del sultán fueron enviados a Portugal como trofeos. Este éxito reforzó la intención de los portugueses de construir una fortaleza en Diu e, indirectamente, pensaban en el envío de dos embajadas, en 1513 y 1514, al sultán Bahadur Shah para negociar la concesión de un sitio para su construcción. Estas embajadas tuvieron poco éxito debido a las maniobras de Malique Aiaz, pero durante la segunda, de la que formó parte Diogo Fernandes, Diogo Teixeira y Ganapotam, este último en calidad de intérprete hindú, se encontraron con el sultán en Madoval (Amedabade) que les ofreció la isla de Amputar como un lugar alternativo. La oferta, sin embargo, fue rechazada por los emisarios portugueses que afirmaban que el virrey solo les había autorizado a aceptar Diu.
Otras incursiones portuguesas en el archipiélago thumb|upright|Lopo Soares de Albergaria, gobernador de la India portuguesa cuando se produjo el ataque a Bombay comandado por John Monroio
En 1517, durante el mandato de Lopo Soares de Albergaria como gobernador de la India portuguesa, John Monroio penetró en la orilla del río Bandora con siete pinaças, donde encontró un navío proveniente del Mar Rojo cargado con mercancías al que atacó. Para tratar de escapar de los portugueses por el río, el barco encalló y la tripulación se puso en fuga, pero algunos de sus miembros fueron capturados por los portugueses y llevados a Chaul. La captura de este navío irritó fuertemente al comandante de Maim, el Jaque-ji, no sólo porque el barco fue atacado frente al mismo, sino también porque su fortaleza había sido bombardeada. Cuando la flota portuguesa se retiró, envió tres pinaças para perseguirlos y evitar que lleguasen a Chaul. Sin embargo, el portugués repelió el ataque y las pinaças del jeque se dieron a la fuga.El relato de estos acontecimientos fue hecha por João de Barros.
Entre 1522 y 1524, durante el mandato Duarte de Meneses como gobernador, fue frecuente ver navíos portugueses dar vueltas en torno a Mumbai en busca de barcos musulmanes y hubo un momento en Malique Aiaz y su flota se vieron obligados a buscar refugio en el puerto de Bombay. En 1526, los portugueses establecieron un puesto comercial en Bassein.
En 1528-1529, el gobernador Lopo Vaz de Sampaio, al mando de una flota de 40 barcos, 1000 soldados portugueses y de algunos otros lugares, atacó a la flota Gujarat cerca de Mumbai que se componía de 68 pinaças y estaba comandada por Camalmaluco Kamal Malik, gobernador y capitán de Diu, y por Ali Xá. Lopo Vaz de Sampaio comenzó por lanzar las anclas a lo largo de una pequeña isla donde estaban las pinaças de Ali Xá, y poco después las retiró y, a la fuerza de remos, las llevó a la desembocadura del río Tana, donde ancló. Durante la noche, el gobernador portugués envió a Vicente Correia a espiar al enemigo. Este vio todos los barcos enemigos a puestos en el lugar de desembarque, a excepción de dos, que quedaron a vigilar la desembocadura del río. Al amparo de la noche, Ali Shah navegaba por el río Nagotana con 20 galeones bien equipados, con galerías en la popa decoradas con lo que el cronista portugués describió como figuras, es decir, versos de la Corán. Lopo Vaz ordenó entonces a Heitor da Silveira fuese al encuentro de Ali Shah y lo atacase, lo que hizo con éxito, habiéndose apoderado de 27 fustas. A continuación, persiguió a Ali Xá hasta una fortaleza vecina cuyos alrededores saqueó, además de apoderarse de mucha artillería enemiga. Para evitar más problemas, el tanedar Por el contexto parece que tanedar era el título de un gobernante independiente o autónomo. Tana se convirtió en vasallo de los portugueses, con la promesa de pagar un tributo anual de 2000 «pardaos». El relato de estos acontecimientos fue hecha por Gaspar Correia thumb|left|Mapa de Bassein (c. 1539), dibujado por Nuno da Cunha, virrey de Goa entre 1528 y 1538