El gobierno de Martín Vizcarra en el Perú comenzó el 23 de marzo de 2018 en medio de una profunda crisis política que trajo consigo tanto la renuncia de Pedro Pablo Kuczynski como la asunción de Vizcarra como jefe de Estado. El gobierno culminó el 9 de noviembre de 2020, cuando el Congreso de la República declaró la «incapacidad moral permanente» de Vizcarra y fue sucedido por el entonces presidente del Congreso de la República, Manuel Merino.
El eslogan de su gobierno fue "El Perú primero".
Toma de mando El día 23 de marzo de 2018, Vizcarra se dirigió al Palacio de Torre Tagle, en donde la canciller Cayetana Aljovín le otorgó la Orden El Sol del Perú en el grado de Gran Collar y la Orden al Mérito por Servicios Distinguidos, en el grado de Gran Cruz Especial por su labor como Embajador del Perú en Canadá. El vicepresidente esperó en la sede de la Cancillería a la comisión de anuncio del Congreso, la cual le invitó a prestar juramento en la sesión solemne del Legislativo.
En el Congreso, Vizcarra fue recibido por una comisión especial y se dirigió al hemiciclo para asumir la Presidencia. En su discurso, el nuevo mandatario definió las líneas políticas que marcarán su gobierno, el enfoque en la educación, el fortalecimiento institucional y la lucha contra la corrupción.
El gobierno de Vizcarra heredó el gabinete ministerial del saliente Kuczynski, que encabezaba la vicepresidenta Mercedes Aráoz. Vizcarra anunció la renovación total del Consejo de Ministros, que sería presentado en un plazo de diez días; mientras tanto, el gabinete Aráoz continuaría en funciones.
El 27 de marzo, Edmer Trujillo Mori juramentó como Ministro de Transportes y Comunicaciones, debido a que el titular en funciones (Bruno Giuffra) se encontraba cuestionado por supuestamente ofrecer obras a congresistas a cambio de que votaran en contra de la vacancia de Kuczynski.
Consejos de Ministros Gabinete Villanueva miniaturadeimagen|El presidente Vizcarra y su primer gabinete ministerial, luego de su juramentación el 2 de abril de 2018.
Juramentación El 2 de abril de 2018 juramentó el nuevo gabinete ministerial, en una ceremonia realizada en el Patio de Honor de Palacio de Gobierno. Vizcarra designó como nuevo Presidente del Consejo de Ministros a César Villanueva, congresista de Alianza para el Progreso y exministro de Ollanta Humala, que fuera el promotor del segundo pedido de vacancia contra Kuczynski. Ello motivo algunas críticas, de quienes vieron que de esa manera Vizcarra recompensaba políticamente a Villanueva y de paso buscaba el apoyo de la mayoría fujimorista del Congreso. Lo cierto es que el nuevo gabinete ministerial obtuvo el voto de confianza del Congreso.
Renuncias ministeriales miniaturadeimagen|El Perú Primero, frase utilizada por el gobierno de Vizcarra para sus políticas. El 22 de abril de 2018, el programa dominical Panorama reveló que el Ministro de la Producción, Daniel Córdova Cayo negoció la salida del viceministro de Pesca para finalizar una huelga de pescadores artesanales. El programa televisivo difundió un vídeo en el cual se ve a los pescadores artesanales reunidos con el ministro Córdoba, quien les ofrece sacar al viceministro de su cargo, a cambio del levantamiento de la huelga. Esto originó un severo cuestionamiento al ministro. El día 25 del mismo mes, César Villanueva anunció que Córdova dejaba su cargo tras haberse aceptado su renuncia.
El 10 de mayo de 2018, mediante un Decreto Supremo, el Ministerio de Economía y Finanzas aprobó la modificación del Impuesto Selectivo al Consumo (ISC) para bebidas alcohólicas y altas en azúcar, así como para vehículos nuevos, cigarrillos y combustible, lo cual generó un amplio debate político-social. A los pocos días, el ministro de Economía, David Tuesta Cárdenas, anunció que el gobierno no retrocedería en el aumento del impuesto. Sin embargo, el presidente Martín Vizcarra anunció que evaluarían las medidas e indicó que si el aumento de los impuestos afecta al pueblo, su gobierno realizaría un ajuste. En medio de la polémica, el Consejo Nacional de Transporte Terrestre (CNTT), que agrupa a los trabajadores en transporte de carga y pasajeros, anunció un paro nacional en reacción al aumento de los combustibles. El Ministerio de Transportes y Comunicaciones llegó a un acuerdo con el CNTT para la devolución del 53,6% del Impuesto Selectivo al Consumo, medida que evitó la realización del paro; sin embargo, debido a la idas y vueltas del Ejecutivo con respecto a ese tema, el ministro Tuesta renunció a su cargo (4 de junio de 2018). En su reemplazo fue nombrado Carlos Oliva, antiguo director del Banco Central de Reserva.
El 13 de julio de 2018, el Ministro de Justicia y Derechos Humanos del Perú Salvador Heresi presentó su carta de renuncia debido a que en uno de los audios revelado en el caso de CNM Audios se le escuchaba conversando con el controvertido juez César Hinostroza. En su reemplazo fue nombrado el abogado y congresista Vicente Zeballos Salinas, que había sido miembro de la bancada parlamentaria de PPK.
El 17 de octubre de 2018, Martín Vizcarra informó que había aceptado la decisión del ministro del Interior Mauro Medina de dar un paso al costado y presentar su renuncia. Ello se dio a consecuencia de la huida a España del juez César Hinostroza, sindicado como cabecilla de la organización Los Cuellos Blancos del Puerto, pese a que tenía impedimento de salida del país desde el 13 de julio. Al día siguiente se presentó ante el pleno Congreso el primer ministro César Villanueva y el ministro de Justicia Vicente Zeballos, para dar explicaciones sobre la fuga del exjuez. Villanueva hizo un mea culpa a nombre del Ejecutivo y anunció que ya se habían tomada acciones inmediatas para lograr la extradición de Hinostroza; en una parte de su alocución dijo que el Ejecutivo conocía de la fuga desde el 7 de octubre (es decir, el mismo día de producirse el hecho), pero luego se rectificó diciendo que en realidad fue desde el día 17, cuando se dio a conocer el suceso. Hubo quienes culparon al Congreso de la huida, por haber demorado en aprobar la denuncia constitucional contra Hinostroza, y una vez aprobada esta, por haber tardado doce días en enviar del expediente a la fiscalía. A diferencia del Ejecutivo, que reconoció parte de su responsabilidad, el presidente del Congreso Daniel Salaverry rechazó cualquier responsabilidad del Legislativo y la achacó toda a la fiscalía y al ministerio del Interior. La bancada aprista anunció que promovería una moción de censura contra Villanueva, aunque el fujimorismo anunció que no la apoyaría. El 19 de octubre juró como nuevo ministro del Interior el general PNP (r) Carlos Morán Soto, exintegrante del Grupo Especial de Inteligencia (GEIN) que participó en la captura de Abimael Guzmán. El 25 de noviembre de 2018 el congresista de Fuerza Popular, Dalmiro Palomino, presidente de la Comisión de Cultura y Patrimonio Cultural, denunció posibles actos de corrupción al interior del ministerio de Cultura. Ello, debido a la revelación de que la empresa Arqueo Andes SAC, del viceministro de esa cartera, Luis Villacorta Ostolaza, había ganado una adjudicación de casi 400 mil soles para hacer una supuesta evaluación arqueológica con fines de delimitación y elaboración de expedientes técnicos. A esto, la ministra de Cultura Patricia Balbuena anunció a través de un comunicado que en aras de asegurar la transparencia del proceso de investigación, el viceministro Villacorta renunciaba al cargo. Sin embargo, al día siguiente, la bancada del Partido Aprista Peruano decidió promover una moción de interpelación contra la ministra, ya que consideraba que había también responsabilidad de esta por haber nombrado al viceministro, y que debía estar al tanto de sus manejos. Al día siguiente, la ministra de Cultura dijo sentirse indignada ante las irregularidades detectadas en el exviceministro Villacorta, asegurando que hubo un abuso de confianza. Aclaró también no haber tenido en el pasado algún vínculo con Luis Villacorta y que su llegada al ministerio se debió a recomendación de especialistas. El 30 de noviembre, Patricia Balbuena presentó su renuncia a su cargo de ministra, lo que fue aceptado por el presidente Vizcarra. El 8 de diciembre de 2018 se anunció que el ministro de Trabajo Christian Sánchez Reyes había renunciado a su cargo. Ello, al parecer, debido a su discrepancia con la reforma laboral planteada por el Ejecutivo. Era notorio que Sánchez no compartía la posición del presidente Vizcarra, que consideraba que una de las causas del elevado nivel de informalidad en el país era el «alto costo laboral no salarial» (aludiendo a pagos de gratificaciones y compensaciones de tiempo de servicio o CTS, entre otros derechos laborales). El 18 de diciembre de 2018 juramentaron tres nuevos ministros de Estado: Sylvia Cáceres juró como ministra de Trabajo y Promoción del Empleo; Rogers Valencia, hasta entonces titular del Ministerio de Comercio Exterior y Turismo, pasó a ser del Ministerio de Cultura; y Édgar Vásquez Vela, hasta entonces viceministro de Comercio Exterior, pasó a encabezar el Ministerio de Comercio Exterior y Turismo. El 3 de enero de 2019, la ministra de Salud Silvia Pessah presentó su carta de renuncia a su cargo, aduciendo motivos personales. La renuncia se dio a conocer el 6 de enero. En su reemplazo juró como nueva ministra de Salud Zulema Tomás Gonzáles, de profesión médico anestesióloga cardiovascular, que hasta ese momento se desempeñaba como directora del Instituto Nacional de Salud del Niño de San Borja. El 6 de marzo de 2019, el presidente del Consejo de Ministros, César Villanueva, presentó su carta de renuncia, la que fue aceptada por el presidente Vizcarra el día 8. Al ser interrogado sobre la razón de su renuncia, Villanueva dijo que simplemente había ya cumplido un ciclo, luego de casi un año de ocupar el cargo. Como lo establece la Constitución, al renunciar el primer ministro se produjo la crisis total del gabinete y todos los ministros pusieron sus cargos a disposición.
Interpelación al ministro Carlos Morán Los congresistas de Fuerza Popular y el Apra presentaron una moción de interpelación contra el ministro del Interior Carlos Morán Soto, tras denunciarse un presunto "chuponeo" o interceptación telefónica contra Alan García, desde una camioneta policial que se hallaba cerca de la vivienda del expresidente, el día 5 de diciembre de 2018. El ministro acudió ante la Comisión de Defensa del Congreso, donde negó que se tratara de una práctica de chuponeo y explicó que el vehículo era de la Unidad de Inteligencia haciendo labor de resguardo. La moción de interpelación fue presentada oficialmente en la sesión del pleno del Congreso del día 17 de diciembre, y se dispuso que fuera puesta a consulta en la sesión siguiente, tal como lo dispone el reglamento.
El 13 de febrero de 2019 se dio a conocer el peritaje solicitado por el Ministerio Público para determinar si hubo alguna interceptación telefónica ilegal contra Alan García. Se determinó que los equipos hallados dentro del vehículo policial no servían para hacer escuchas de este tipo de comunicaciones. El 8 de marzo de 2019, el pleno del Congreso rechazó la moción para interpelar a Morán, por 29 votos a favor, 24 en contra y 21 abstenciones.
Gabinete Del Solar Juramentación miniaturadeimagen|Luis Castillo Butters, Salvador del Solar, Martín Vizcarra y Jorge Moscoso.